47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0108 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0108  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  1.3521599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2900  hypothetical protein  37.64 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0591  hypothetical protein  37.82 
 
 
172 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.59111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0500  hypothetical protein  37.42 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1667  hypothetical protein  35.62 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0837256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2641  hypothetical protein  34.12 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4483  hypothetical protein  33.12 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  32.53 
 
 
180 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000110374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2437  hypothetical protein  29.82 
 
 
174 aa  84.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  30.92 
 
 
233 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  30.41 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0746  hypothetical protein  30.41 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  33.97 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  30.92 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  32.94 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  31.79 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3640  hypothetical protein  32.26 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000000227371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  28.14 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2371  hypothetical protein  28.99 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340146  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0023  hypothetical protein  28.22 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  25.27 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  30.63 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00685  hypothetical protein  25.89 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0834282  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5582  hypothetical protein  28.83 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238097  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2690  hypothetical protein  25.51 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2705  hypothetical protein  25.51 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.953321  normal  0.0204649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2660  hypothetical protein  25.51 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  29.93 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3453  hypothetical protein  26.96 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.948893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2513  hypothetical protein  30.57 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  27.33 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  26.75 
 
 
303 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1349  hypothetical protein  24.82 
 
 
266 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  0.0687913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5198  hypothetical protein  29.11 
 
 
211 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1093  hypothetical protein  25.81 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2178  hypothetical protein  28.71 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.570864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1547  hypothetical protein  25.13 
 
 
254 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1160  hypothetical protein  25.89 
 
 
248 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3925  hypothetical protein  25.52 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.750282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2321  hypothetical protein  24.51 
 
 
240 aa  55.1  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4728  hypothetical protein  25.86 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.114541  normal  0.213547 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0887  hypothetical protein  25 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106843  hitchhiker  0.000000000926044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2460  hypothetical protein  27.11 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2345  hypothetical protein  36.51 
 
 
98 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.938426  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2180  hypothetical protein  25.25 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4943  hypothetical protein  22.46 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00429148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>