More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0096 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
117 aa  234  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  92.31 
 
 
117 aa  222  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  92.31 
 
 
117 aa  222  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  89.74 
 
 
117 aa  216  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  88.03 
 
 
118 aa  213  6e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  82.76 
 
 
118 aa  200  5e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  77.59 
 
 
116 aa  186  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1750  50S ribosomal protein L17  85.71 
 
 
99 aa  174  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00132391  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1007  50S ribosomal protein L17  83.67 
 
 
99 aa  170  6e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.168469  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0328  50S ribosomal protein L17  76.72 
 
 
116 aa  162  1e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  54.4 
 
 
125 aa  136  8e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  51.72 
 
 
116 aa  127  5e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 
116 aa  125  2e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  2.40801e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 
141 aa  125  2e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  124  4e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
141 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
132 aa  123  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  51.72 
 
 
139 aa  123  8e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
132 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  7.19961e-05 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
132 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
131 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  52.99 
 
 
118 aa  120  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  51.35 
 
 
113 aa  120  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 
140 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  55.17 
 
 
117 aa  120  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
137 aa  119  1e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  52.29 
 
 
114 aa  118  2e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  49.09 
 
 
112 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  50.86 
 
 
130 aa  117  4e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
151 aa  117  4e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  48.72 
 
 
126 aa  117  5e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
139 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 
161 aa  116  8e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 
136 aa  115  1e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
116 aa  116  1e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  116  1e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
137 aa  116  1e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
132 aa  116  1e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  4.36647e-08 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  116  1e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  116  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  116  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
131 aa  116  1e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
129 aa  115  2e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
112 aa  115  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.98381e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
131 aa  115  2e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
131 aa  115  2e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
131 aa  115  2e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
131 aa  115  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
131 aa  115  2e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 
132 aa  115  2e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  50 
 
 
119 aa  115  2e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
129 aa  115  2e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
131 aa  115  2e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  49.14 
 
 
143 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 
139 aa  114  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
141 aa  114  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  46.55 
 
 
131 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
141 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  49.14 
 
 
131 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 
132 aa  115  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 
113 aa  114  4e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 
113 aa  114  4e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
132 aa  114  4e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
138 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
130 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  3.62399e-08 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
130 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
166 aa  113  8e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
138 aa  113  9e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
142 aa  112  1e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 
139 aa  112  1e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  47.75 
 
 
112 aa  112  1e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  49.14 
 
 
134 aa  112  1e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
142 aa  112  1e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  49.14 
 
 
131 aa  112  1e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
138 aa  112  1e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 
195 aa  112  2e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
140 aa  112  2e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
147 aa  112  2e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
135 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  43.1 
 
 
151 aa  112  2e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0290  ribosomal protein L17  46.15 
 
 
117 aa  112  2e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  48.28 
 
 
137 aa  112  2e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
126 aa  112  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
139 aa  112  2e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 
152 aa  112  2e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
139 aa  112  2e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 
195 aa  112  2e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  50.93 
 
 
195 aa  112  2e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
138 aa  112  2e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
138 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
141 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
129 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  47.41 
 
 
168 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  49.14 
 
 
132 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 
127 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>