More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0090 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0090  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.146045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1012  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 
72 aa  145  1e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631834  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1755  translation initiation factor IF-1  93.06 
 
 
72 aa  145  2e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0524428  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0055  translation initiation factor IF-1  93.06 
 
 
72 aa  145  2e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0209  translation initiation factor IF-1  94.44 
 
 
72 aa  145  2e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1944  translation initiation factor IF-1  93.06 
 
 
72 aa  142  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.25939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  93.06 
 
 
72 aa  142  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  93.06 
 
 
72 aa  142  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1947  translation initiation factor IF-1  88.89 
 
 
72 aa  137  5e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0307  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  132  2e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  69.44 
 
 
73 aa  116  8e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  116  1e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  114  4e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.06677e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  114  4e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.87625e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.8346e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.09815e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.23661e-11  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  7.69266e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.31634e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.19097e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.60601e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.50239e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  113  7e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.19555e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2738  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3623  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000249232  hitchhiker  1.54943e-11 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  112  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  68.06 
 
 
72 aa  112  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  111  4e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.27108e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1945  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  4e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3499  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  4e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2611  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  4e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.430163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  111  4e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3148  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  4e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4222  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0496  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  110  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3928  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  110  7e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  66.67 
 
 
72 aa  110  7e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  63.89 
 
 
87 aa  110  8e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04255e-05 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.56493e-07  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2998  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  110  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.98783e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
73 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  1.64388e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  109  1e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3422  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  109  1e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  109  1e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  3.71749e-08  hitchhiker  4.19913e-09 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  109  1e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1729  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  2e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  63.89 
 
 
85 aa  109  2e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  2e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  108  2e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  2e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  109  2e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.04366e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  2e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.52368e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 
83 aa  108  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.20042e-14  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1790  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  68.57 
 
 
73 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  4e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.28141e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  107  4e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  63.89 
 
 
72 aa  107  4e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.77018e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  3.10182e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  70 
 
 
73 aa  107  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 
71 aa  107  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  61.97 
 
 
71 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  2.52323e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2944  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
73 aa  107  7e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2659  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
73 aa  107  7e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23570  translation initiation factor 1  67.14 
 
 
73 aa  107  8e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
75 aa  106  9e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
75 aa  106  9e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 
73 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
73 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 
73 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
75 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.18167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  67.14 
 
 
73 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
73 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
73 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
73 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>