276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0088 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  100 
 
 
306 aa  638  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  66.34 
 
 
304 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  66.34 
 
 
304 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  45.83 
 
 
466 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  45.49 
 
 
466 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  45.49 
 
 
466 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  48.08 
 
 
330 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  45.49 
 
 
466 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  45.49 
 
 
465 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.49 
 
 
465 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  45.49 
 
 
465 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.49 
 
 
465 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  45.49 
 
 
465 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  45.49 
 
 
465 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.49 
 
 
465 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  45.49 
 
 
466 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  44.79 
 
 
463 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  45.8 
 
 
333 aa  251  8e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  44.16 
 
 
328 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  44.33 
 
 
473 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  45.45 
 
 
333 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  45.45 
 
 
333 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  45.8 
 
 
333 aa  250  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  46.15 
 
 
330 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  44.48 
 
 
330 aa  248  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  44.98 
 
 
459 aa  248  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  44.98 
 
 
459 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  44.98 
 
 
459 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  45.36 
 
 
464 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  43.81 
 
 
333 aa  248  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  44.82 
 
 
344 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  44.91 
 
 
351 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  44.48 
 
 
344 aa  245  7e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  44.48 
 
 
344 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  44.48 
 
 
344 aa  244  1e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  41.47 
 
 
377 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  43.16 
 
 
352 aa  240  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  43.05 
 
 
397 aa  239  3e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  43.21 
 
 
352 aa  239  3e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  42.71 
 
 
322 aa  237  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  42.16 
 
 
342 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  43.92 
 
 
352 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  3.25432e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  43.69 
 
 
314 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  42.81 
 
 
331 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  40.66 
 
 
339 aa  236  5e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  43.64 
 
 
437 aa  233  2e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  43.1 
 
 
331 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  45.22 
 
 
384 aa  233  4e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  42.11 
 
 
355 aa  233  4e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  43.24 
 
 
459 aa  232  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  1.59552e-06  hitchhiker  3.91154e-14 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  42.71 
 
 
371 aa  232  7e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  42.11 
 
 
333 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  41.9 
 
 
353 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  41.75 
 
 
333 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  42.52 
 
 
343 aa  229  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  40.7 
 
 
333 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  44.28 
 
 
332 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  40.92 
 
 
317 aa  225  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  43.91 
 
 
332 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  40.52 
 
 
340 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  41.28 
 
 
346 aa  221  1e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  41.36 
 
 
324 aa  221  2e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  41.61 
 
 
346 aa  221  2e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  39.73 
 
 
357 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  40.19 
 
 
345 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  42.86 
 
 
358 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  41.75 
 
 
330 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  42.05 
 
 
346 aa  215  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  40.21 
 
 
309 aa  215  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2106  cytochrome-c peroxidase  38.89 
 
 
349 aa  214  1e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  42.03 
 
 
351 aa  214  1e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  40.14 
 
 
346 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  39.2 
 
 
348 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  42.5 
 
 
345 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  39.79 
 
 
346 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.07 
 
 
345 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  39.74 
 
 
350 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  41.07 
 
 
346 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  38.74 
 
 
359 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  37.92 
 
 
349 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  36.21 
 
 
332 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  39.74 
 
 
346 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  6.33381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  35.99 
 
 
386 aa  199  4e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06168  cytochrome c551 peroxidase  38.21 
 
 
323 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  42.09 
 
 
344 aa  197  2e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  40.29 
 
 
344 aa  195  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  41.24 
 
 
341 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  41.24 
 
 
341 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00242  cytochrome C peroxidase  37.59 
 
 
330 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  37.54 
 
 
347 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000355  cytochrome c551 peroxidase  39.1 
 
 
325 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  38.63 
 
 
335 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  37.68 
 
 
334 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  38.21 
 
 
347 aa  189  6e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  38.21 
 
 
347 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  35.31 
 
 
311 aa  174  2e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  36.81 
 
 
342 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  6.61029e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1108  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase; CCP)  32.67 
 
 
287 aa  170  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0173409  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1734  cytochrome c551 peroxidase  36.49 
 
 
271 aa  169  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.841983  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  37.5 
 
 
338 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>