More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0087 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  100 
 
 
600 aa  1181  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0019  methyl-accepting chemotaxis protein  53.48 
 
 
593 aa  549  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0046  methyl-accepting chemotaxis protein  52.78 
 
 
584 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 
530 aa  178  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
530 aa  141  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  33.33 
 
 
661 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
563 aa  134  4e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 
713 aa  134  7e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 
625 aa  133  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
650 aa  131  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 
621 aa  131  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  35.94 
 
 
566 aa  131  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 
627 aa  131  4e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 
698 aa  129  1e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 
708 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  39.32 
 
 
626 aa  127  7e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 
547 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 
668 aa  121  4e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 
656 aa  120  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  34.21 
 
 
656 aa  120  1e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
633 aa  119  1e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  32.37 
 
 
563 aa  119  1e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  28.37 
 
 
538 aa  118  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.44 
 
 
638 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  29.08 
 
 
559 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.19 
 
 
659 aa  118  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 
532 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 
532 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.39 
 
 
632 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  32.07 
 
 
650 aa  117  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  27.22 
 
 
549 aa  117  8e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0562  putative methyl-accepting chemotaxis protein  30.94 
 
 
530 aa  116  9e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 
626 aa  116  1e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0544  MCP-domain signal transduction protein  32.02 
 
 
530 aa  116  1e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.05 
 
 
509 aa  116  2e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 
539 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.98 
 
 
705 aa  115  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 
652 aa  114  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0916  methyl-accepting chemotaxis protein  29.35 
 
 
543 aa  114  7e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.9497e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  31.56 
 
 
545 aa  114  7e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 
638 aa  114  7e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0818  chemotaxis sensory transducer  30.72 
 
 
590 aa  113  8e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  26.67 
 
 
528 aa  112  1e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0570  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 
674 aa  113  1e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.84 
 
 
622 aa  113  1e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 
715 aa  113  1e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2472  methyl-accepting chemotaxis protein  32.89 
 
 
661 aa  112  2e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.54 
 
 
638 aa  112  2e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3730  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 
529 aa  112  2e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.64918e-07 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  26.99 
 
 
714 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  30.18 
 
 
564 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.7467e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0103  methyl-accepting chemotaxis protein  34.92 
 
 
521 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 
714 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 
620 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.6 
 
 
636 aa  112  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.54 
 
 
807 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.46 
 
 
706 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.1 
 
 
714 aa  111  4e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.1 
 
 
714 aa  111  4e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 
554 aa  111  4e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 
554 aa  111  4e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  32.24 
 
 
546 aa  111  4e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  26.7 
 
 
645 aa  111  4e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
620 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.7 
 
 
533 aa  111  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
620 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.61 
 
 
554 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  29.5 
 
 
701 aa  110  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  24.83 
 
 
714 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 
661 aa  110  9e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 
533 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.15 
 
 
541 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  52.46 
 
 
545 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  31.16 
 
 
623 aa  110  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 
639 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.52719e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  25.98 
 
 
713 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  27.67 
 
 
712 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 
554 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 
659 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 
563 aa  110  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.73 
 
 
554 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  53.39 
 
 
657 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 
560 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  34.89 
 
 
697 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 
682 aa  109  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.34 
 
 
533 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  52.46 
 
 
652 aa  109  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31 
 
 
620 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  26.37 
 
 
578 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  29.57 
 
 
646 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  28.46 
 
 
700 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2237  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 
661 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.551171  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  32.53 
 
 
533 aa  108  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.73 
 
 
554 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4711  methyl-accepting chemotaxis protein  30.58 
 
 
633 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 
555 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  41.94 
 
 
731 aa  108  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.35 
 
 
695 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 
540 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.27 
 
 
688 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>