78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0082 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  320  3e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  60 
 
 
160 aa  211  4e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  60 
 
 
160 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  58.71 
 
 
160 aa  206  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  45.03 
 
 
157 aa  137  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  44.65 
 
 
173 aa  137  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  40.38 
 
 
173 aa  128  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  5.35646e-09  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  40 
 
 
447 aa  126  1e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  38.75 
 
 
172 aa  125  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.5 
 
 
185 aa  118  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  37.27 
 
 
184 aa  116  1e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  35.85 
 
 
168 aa  110  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  36.48 
 
 
171 aa  108  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  38.03 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  35.37 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  35.48 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  34.46 
 
 
180 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  36.76 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0991  hypothetical protein  32.89 
 
 
166 aa  89  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.229474 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  33.33 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  32.64 
 
 
158 aa  87  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  34 
 
 
163 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  36.69 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  30.92 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  32.21 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  32.1 
 
 
188 aa  84.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  31.41 
 
 
158 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0825  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  29.5 
 
 
204 aa  82.4  2e-15  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0073415  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  32.64 
 
 
158 aa  82.8  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  32.64 
 
 
158 aa  82.8  2e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  32.64 
 
 
158 aa  82.8  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  32.64 
 
 
158 aa  82.8  2e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  32.64 
 
 
158 aa  82.8  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  32.64 
 
 
158 aa  82.8  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.26 
 
 
166 aa  81.6  3e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  32.87 
 
 
157 aa  82  3e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  32.87 
 
 
158 aa  81.3  5e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3415  hypothetical protein  30.38 
 
 
207 aa  80.9  6e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0418768  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2749  hypothetical protein  30.38 
 
 
184 aa  80.9  7e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288888  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  32.26 
 
 
185 aa  80.5  8e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  32.87 
 
 
158 aa  80.1  1e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  28.1 
 
 
175 aa  80.1  1e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  32.39 
 
 
157 aa  79.7  1e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  32.87 
 
 
158 aa  80.1  1e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  28.83 
 
 
165 aa  77.8  5e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  29.05 
 
 
168 aa  77.8  6e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2505  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.88 
 
 
164 aa  77.4  7e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.635116  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.61 
 
 
165 aa  77  9e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299989  normal  0.705929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2341  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34 
 
 
167 aa  77  9e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5397  hypothetical protein  27.45 
 
 
181 aa  77  1e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538915  normal  0.547582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  25.17 
 
 
175 aa  76.6  1e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  31.72 
 
 
162 aa  76.6  1e-13  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.25 
 
 
167 aa  75.9  2e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  32.88 
 
 
157 aa  76.3  2e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.49 
 
 
168 aa  74.7  5e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  31.72 
 
 
171 aa  74.3  5e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  31.25 
 
 
160 aa  74.3  6e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1979  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  32.61 
 
 
168 aa  73.9  7e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3950  hypothetical protein  31.33 
 
 
165 aa  73.6  1e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3964  hypothetical protein  31.33 
 
 
165 aa  73.6  1e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0376282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4024  hypothetical protein  31.33 
 
 
165 aa  73.6  1e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0189613  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0737  hypothetical protein  33.91 
 
 
158 aa  72.4  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  29.63 
 
 
174 aa  72.8  2e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  29.17 
 
 
171 aa  72.4  3e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3867  hypothetical protein  33.12 
 
 
176 aa  71.2  5e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.674324  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1066  hypothetical protein  27.39 
 
 
196 aa  70.9  6e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187825  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3884  hypothetical protein  25.15 
 
 
173 aa  69.3  2e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0934  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.88 
 
 
155 aa  66.6  1e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242061  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4453  hypothetical protein  26.62 
 
 
167 aa  66.2  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497165  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.26 
 
 
190 aa  65.9  2e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  29.3 
 
 
196 aa  65.9  2e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1611  hypothetical protein  28.57 
 
 
217 aa  60.8  7e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2242  hypothetical protein  24.43 
 
 
155 aa  58.5  4e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1394  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  55.8  2e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.138559  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2262  hypothetical protein  27.13 
 
 
239 aa  47.8  6e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.051771  hitchhiker  0.00807275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0856  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  27.64 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893895  normal  0.15216 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1966  hypothetical protein  26.36 
 
 
239 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.73839  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2258  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  22.36 
 
 
211 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.30044e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>