222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0081 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  100 
 
 
215 aa  440  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  91.26 
 
 
183 aa  349  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  91.26 
 
 
183 aa  349  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  91.26 
 
 
183 aa  349  2e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  76.74 
 
 
216 aa  348  5e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.15937e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  73.95 
 
 
214 aa  340  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  2.89321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  68.52 
 
 
215 aa  302  3e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  50 
 
 
179 aa  155  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  46.28 
 
 
191 aa  150  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  49.7 
 
 
392 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  43.48 
 
 
191 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  1.1253e-05 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  46.47 
 
 
179 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  42.78 
 
 
178 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  41.58 
 
 
197 aa  140  2e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  42.78 
 
 
190 aa  139  2e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  44.09 
 
 
192 aa  139  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  45.61 
 
 
178 aa  138  5e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  44.44 
 
 
178 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  43.75 
 
 
188 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  41.18 
 
 
194 aa  136  3e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  41.71 
 
 
194 aa  136  3e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  41.71 
 
 
194 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  43.46 
 
 
190 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  41.24 
 
 
191 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  41.05 
 
 
191 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  40 
 
 
221 aa  134  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.56435e-05  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  46.15 
 
 
179 aa  134  1e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  41.4 
 
 
190 aa  134  1e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  40.72 
 
 
191 aa  134  1e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  43.79 
 
 
179 aa  134  1e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  46.15 
 
 
179 aa  134  1e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  44.38 
 
 
180 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  43.68 
 
 
181 aa  133  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.48271e-09  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  46.15 
 
 
179 aa  132  4e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  43.33 
 
 
192 aa  132  4e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  42.39 
 
 
191 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  38.66 
 
 
191 aa  131  8e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  40.22 
 
 
190 aa  130  1e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  42.61 
 
 
178 aa  130  1e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  40.21 
 
 
191 aa  130  2e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  39.89 
 
 
191 aa  130  2e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.72055e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  41.94 
 
 
190 aa  130  2e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  44.07 
 
 
178 aa  130  2e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  44.38 
 
 
177 aa  130  2e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.07911e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  40.11 
 
 
195 aa  129  2e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  41.18 
 
 
194 aa  129  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  44.97 
 
 
179 aa  129  4e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  41.21 
 
 
191 aa  129  4e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.75235e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  40.21 
 
 
191 aa  129  5e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.77128e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  42.6 
 
 
696 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  42.6 
 
 
696 aa  126  2e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  38.83 
 
 
195 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  38.3 
 
 
195 aa  124  8e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  46.75 
 
 
177 aa  124  8e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  40.86 
 
 
191 aa  124  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  34.72 
 
 
194 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  40.32 
 
 
192 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  36.7 
 
 
191 aa  121  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  6.54398e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  39.55 
 
 
190 aa  121  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  40.45 
 
 
178 aa  120  1e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  41.42 
 
 
179 aa  120  1e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  40.45 
 
 
178 aa  120  1e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  39.44 
 
 
233 aa  120  1e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  41.53 
 
 
196 aa  120  2e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  41.92 
 
 
172 aa  119  4e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  39.25 
 
 
191 aa  116  2e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  37.36 
 
 
194 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.4183e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  43.45 
 
 
165 aa  110  2e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  39.25 
 
 
192 aa  109  4e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  42.86 
 
 
165 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  37.36 
 
 
196 aa  106  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  42.26 
 
 
165 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  40.35 
 
 
167 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  39.88 
 
 
166 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  38.92 
 
 
165 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  35.06 
 
 
263 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  37.36 
 
 
173 aa  101  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  34.34 
 
 
164 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.58071e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  40 
 
 
165 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  34.59 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  38.82 
 
 
166 aa  99.8  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  32.61 
 
 
185 aa  99  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  40.35 
 
 
164 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  37.72 
 
 
166 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  39.88 
 
 
164 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  39.51 
 
 
165 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  40.72 
 
 
166 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  40 
 
 
166 aa  94  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  41.36 
 
 
166 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  40.62 
 
 
166 aa  92.8  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  37.72 
 
 
166 aa  92.4  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  36.84 
 
 
163 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  36.69 
 
 
164 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  37.78 
 
 
164 aa  90.9  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  35.98 
 
 
168 aa  91.3  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  35.8 
 
 
170 aa  90.1  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  2.07736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  35.8 
 
 
170 aa  90.1  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  37.77 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  37.06 
 
 
166 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  35.12 
 
 
166 aa  89.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>