More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0080 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  100 
 
 
348 aa  699  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  81.61 
 
 
348 aa  579  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  80.17 
 
 
348 aa  572  1e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  79.33 
 
 
331 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  52.56 
 
 
352 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  52.27 
 
 
352 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  52.27 
 
 
352 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  52.42 
 
 
356 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  55.68 
 
 
344 aa  349  5e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  52.87 
 
 
348 aa  342  5e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  52.14 
 
 
347 aa  337  1e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  52.14 
 
 
347 aa  328  9e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  2.14281e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  52.66 
 
 
348 aa  328  1e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.30453e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  52.42 
 
 
354 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  52.12 
 
 
338 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  52.96 
 
 
338 aa  321  9e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  50 
 
 
352 aa  317  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  49.71 
 
 
346 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  52.56 
 
 
348 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  52.56 
 
 
348 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  52.56 
 
 
348 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  53.33 
 
 
348 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  52.56 
 
 
348 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  52.56 
 
 
348 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  52.27 
 
 
348 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  51.75 
 
 
348 aa  316  5e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  52.27 
 
 
348 aa  315  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  52.27 
 
 
348 aa  315  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  52.27 
 
 
348 aa  315  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  52.27 
 
 
348 aa  315  1e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  52.27 
 
 
348 aa  315  1e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  52.27 
 
 
348 aa  315  1e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  51.3 
 
 
348 aa  314  1e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  52.27 
 
 
348 aa  315  1e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  49.57 
 
 
355 aa  313  3e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  49.13 
 
 
346 aa  313  3e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  51.99 
 
 
348 aa  313  4e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  51.21 
 
 
348 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3114  L-asparaginase, type II  49.28 
 
 
348 aa  308  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  48.85 
 
 
345 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  48.85 
 
 
345 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3912  L-asparaginase  50.15 
 
 
347 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278506  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3973  L-asparaginase  50.15 
 
 
347 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  48.85 
 
 
345 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3804  L-asparaginase  47.58 
 
 
347 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3870  L-asparaginase  49.85 
 
 
347 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3792  L-asparaginase  49.85 
 
 
347 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0751735  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  51.83 
 
 
316 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  47.11 
 
 
339 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0564  L-asparaginase, type II  48.48 
 
 
378 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  47.15 
 
 
347 aa  285  6e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  45.83 
 
 
338 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  46.85 
 
 
396 aa  282  5e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  46.85 
 
 
347 aa  282  7e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  46.85 
 
 
347 aa  282  7e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  46.85 
 
 
347 aa  282  7e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  46.85 
 
 
347 aa  282  7e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  46.85 
 
 
347 aa  282  7e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  46.85 
 
 
347 aa  282  7e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3136  L-asparaginase, type II  45.76 
 
 
373 aa  282  7e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  46.36 
 
 
346 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3863  L-asparaginases, type II  45.76 
 
 
366 aa  281  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.354581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1812  L-asparaginase, type II  46.47 
 
 
374 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1583  asparaginase  47.54 
 
 
375 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000246256  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0442  L-asparaginases, type II  45.15 
 
 
379 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228079  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  46.78 
 
 
349 aa  275  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1955  L-asparaginase, type II  47.39 
 
 
362 aa  275  1e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3237  L-asparaginase, type II  47.71 
 
 
362 aa  275  1e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  47.62 
 
 
340 aa  274  1e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  45.59 
 
 
340 aa  274  2e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  45.87 
 
 
340 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  45.87 
 
 
340 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2453  L-asparaginase, type II  47.39 
 
 
362 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  46.67 
 
 
365 aa  273  4e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  46.67 
 
 
365 aa  273  4e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3493  L-asparaginase, type II  47.39 
 
 
362 aa  273  5e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  45.57 
 
 
340 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1917  L-asparaginase, type II  46.73 
 
 
362 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155631  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4206  L-asparaginases, type II  43.64 
 
 
356 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2689  L-asparaginase, type II  44.19 
 
 
356 aa  269  6e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.373089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3427  L-asparaginase, type II  47.27 
 
 
373 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4748  L-asparaginase, type II  45.76 
 
 
356 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4228  L-asparaginase, type II  41.14 
 
 
330 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965091  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07280  L-asparaginase, type II  45.02 
 
 
362 aa  263  5e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5349  L-asparaginase, type II  45.22 
 
 
372 aa  259  5e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4048  glutaminase-asparaginase  46.08 
 
 
350 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493489  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4182  L-asparaginases, type II  42.9 
 
 
365 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428323  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46970  glutaminase-asparaginase  46.41 
 
 
362 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013825  normal  0.0254019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5042  L-asparaginase, type II  44.41 
 
 
369 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  44.82 
 
 
323 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1913  glutaminase-(asparagin-)ase  43.4 
 
 
363 aa  252  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.252419  normal  0.323954 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00300  asparaginase, aspartic hydroxamate res. (Eurofung)  44.95 
 
 
378 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0205708  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  43.23 
 
 
367 aa  248  9e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  40.79 
 
 
330 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  41.87 
 
 
330 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2007  L-asparaginase, type II  43.33 
 
 
378 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.354174  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2449  asparaginase  40.19 
 
 
327 aa  235  1e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  41.74 
 
 
333 aa  233  4e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00150  L-asparaginase type II family protein  40.84 
 
 
328 aa  229  6e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.589872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0801  Asparaginase  41.12 
 
 
340 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>