More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0079 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0079  glutamate racemase  100 
 
 
246 aa  496  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2013  glutamate racemase  63.41 
 
 
247 aa  319  2e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1824  glutamate racemase  63.41 
 
 
247 aa  319  3e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1643  glutamate racemase  63.41 
 
 
247 aa  318  5e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1554  glutamate racemase  55.28 
 
 
247 aa  290  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  34.98 
 
 
285 aa  171  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  38.55 
 
 
258 aa  168  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  36.65 
 
 
275 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  40.08 
 
 
267 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  41.2 
 
 
259 aa  166  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  36.65 
 
 
259 aa  165  6e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  36.65 
 
 
259 aa  165  6e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  36 
 
 
276 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  40.95 
 
 
275 aa  164  1e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  40.95 
 
 
275 aa  164  1e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  38.25 
 
 
266 aa  163  2e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  37.05 
 
 
259 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  36.65 
 
 
272 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  36.51 
 
 
276 aa  162  5e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  41.1 
 
 
264 aa  162  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  32.95 
 
 
282 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  40.09 
 
 
265 aa  162  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  36 
 
 
278 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  31.85 
 
 
308 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  36 
 
 
278 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  38.18 
 
 
291 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  38.15 
 
 
264 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  38.49 
 
 
270 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  32.81 
 
 
272 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  36.95 
 
 
264 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  34 
 
 
272 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  33.87 
 
 
268 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  5.12985e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1160  glutamate racemase  40.49 
 
 
276 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  38.27 
 
 
272 aa  152  3e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  35.6 
 
 
267 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  37.19 
 
 
271 aa  151  9e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  37.55 
 
 
274 aa  150  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  33.6 
 
 
288 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  39.72 
 
 
281 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  36.55 
 
 
259 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  43.52 
 
 
269 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  34.65 
 
 
265 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  33.97 
 
 
295 aa  148  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  38.74 
 
 
268 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  35.06 
 
 
256 aa  145  4e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  34 
 
 
289 aa  145  4e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  35.34 
 
 
271 aa  146  4e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  32.8 
 
 
281 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  5.32867e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  32.02 
 
 
280 aa  145  7e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  38.99 
 
 
273 aa  145  7e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06751  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  33.46 
 
 
265 aa  145  8e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  31.62 
 
 
280 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  42.52 
 
 
269 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  36.55 
 
 
260 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  35.74 
 
 
264 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  35.37 
 
 
276 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.16913e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0153  glutamate racemase  31.45 
 
 
263 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  3.23357e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  31.73 
 
 
292 aa  141  1e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  35.71 
 
 
267 aa  140  2e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  35.83 
 
 
268 aa  140  2e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  32.14 
 
 
291 aa  140  2e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  34.25 
 
 
266 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  34.25 
 
 
266 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  34.13 
 
 
261 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.09629e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  33.73 
 
 
262 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  32.94 
 
 
272 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  30.4 
 
 
295 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  34 
 
 
267 aa  138  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  34.23 
 
 
284 aa  138  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  2.13664e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  34.4 
 
 
267 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0061  glutamate racemase  35.94 
 
 
275 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.21676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10321  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  35.43 
 
 
267 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22912  normal  0.716928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  34 
 
 
269 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  34 
 
 
269 aa  134  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  34 
 
 
269 aa  134  1e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  34 
 
 
269 aa  134  1e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  34 
 
 
269 aa  134  1e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  34 
 
 
269 aa  134  1e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.52581e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  34 
 
 
269 aa  134  1e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  34 
 
 
267 aa  134  1e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  34 
 
 
269 aa  134  1e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  32.94 
 
 
282 aa  133  2e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  31.1 
 
 
268 aa  134  2e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  32.39 
 
 
311 aa  133  2e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  33.6 
 
 
269 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  29.48 
 
 
279 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1372  glutamate racemase  37.45 
 
 
263 aa  132  7e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  30.65 
 
 
307 aa  132  7e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  29.48 
 
 
279 aa  131  8e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  30 
 
 
283 aa  131  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  34.7 
 
 
270 aa  130  1e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06821  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  33.86 
 
 
264 aa  129  4e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.876328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  30.52 
 
 
278 aa  129  5e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  32 
 
 
281 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  32 
 
 
281 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  31.17 
 
 
270 aa  127  2e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  31.28 
 
 
276 aa  126  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  33.86 
 
 
268 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1136  glutamate racemase  30.71 
 
 
265 aa  126  4e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204541  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  31.43 
 
 
280 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.63205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>