More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0078 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  80.71 
 
 
420 aa  696  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  84.8 
 
 
421 aa  721  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  85.27 
 
 
421 aa  724  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0078  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
420 aa  831  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  78.15 
 
 
421 aa  672  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  85.51 
 
 
421 aa  726  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  83.1 
 
 
420 aa  694  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  73.1 
 
 
420 aa  603  1e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1757  preprotein translocase subunit SecY  82.95 
 
 
352 aa  575  1e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  44.31 
 
 
437 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  44.74 
 
 
437 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  44.55 
 
 
437 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.8 
 
 
435 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  44.88 
 
 
435 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.17 
 
 
435 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.45 
 
 
437 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  42.44 
 
 
435 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02472e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 
435 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 
435 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  42.44 
 
 
435 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  8.11889e-07 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.2 
 
 
429 aa  358  7e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  45.32 
 
 
442 aa  358  1e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  42.45 
 
 
443 aa  357  2e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  2.66535e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  42.45 
 
 
443 aa  357  2e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  42.07 
 
 
444 aa  357  2e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  41.71 
 
 
435 aa  356  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  43.99 
 
 
435 aa  351  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.7617e-05  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  43.1 
 
 
440 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  42.79 
 
 
437 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  42.93 
 
 
441 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  41.65 
 
 
437 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  41.97 
 
 
441 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.17 
 
 
442 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.52006e-07  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  43.2 
 
 
443 aa  344  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  47.84 
 
 
430 aa  345  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 
437 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  43.44 
 
 
446 aa  343  3e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  41.44 
 
 
436 aa  341  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  42 
 
 
446 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 
440 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  7.06243e-08 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  41.87 
 
 
446 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  42.48 
 
 
445 aa  340  3e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  41.11 
 
 
445 aa  340  3e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  41.87 
 
 
446 aa  340  4e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  41.73 
 
 
437 aa  339  5e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 
446 aa  338  1e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.58427e-07  unclonable  8.37901e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
446 aa  337  2e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.08952e-07  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
446 aa  337  2e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.09869e-07  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  42.96 
 
 
447 aa  337  3e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.45 
 
 
445 aa  336  4e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  42.72 
 
 
447 aa  336  4e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
434 aa  335  7e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  41.09 
 
 
453 aa  335  7e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 
439 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  41.76 
 
 
443 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  41.76 
 
 
443 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  40.87 
 
 
443 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  43.1 
 
 
443 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  1.93642e-05  unclonable  4.48849e-12 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  41.49 
 
 
442 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  8.98122e-06  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  41.29 
 
 
439 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  41.29 
 
 
439 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 
443 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  41.53 
 
 
443 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  41.53 
 
 
443 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  4.33507e-06 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  41.49 
 
 
420 aa  333  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  41.26 
 
 
444 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  41.26 
 
 
444 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  40.62 
 
 
446 aa  332  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.14541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  40.55 
 
 
436 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 
448 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.24 
 
 
446 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  40.8 
 
 
437 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  44.29 
 
 
448 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  42.48 
 
 
447 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  41.44 
 
 
436 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  40.55 
 
 
439 aa  330  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  40.87 
 
 
443 aa  330  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  41.75 
 
 
442 aa  330  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  43.2 
 
 
424 aa  329  5e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  40.24 
 
 
446 aa  329  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.81445e-07  unclonable  1.05897e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  41.11 
 
 
444 aa  328  1e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  43.91 
 
 
447 aa  327  2e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
446 aa  327  2e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  6.62692e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  41.09 
 
 
437 aa  327  2e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  40.38 
 
 
446 aa  328  2e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.11222e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  40.66 
 
 
442 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  40.66 
 
 
442 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  39.01 
 
 
444 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.17062e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  40.62 
 
 
448 aa  326  4e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
446 aa  326  4e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  39.9 
 
 
439 aa  326  4e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  41.43 
 
 
448 aa  326  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  39.49 
 
 
443 aa  326  5e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  39.25 
 
 
443 aa  326  5e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  41.63 
 
 
444 aa  326  5e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.20552e-06 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  41.2 
 
 
448 aa  324  2e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
446 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.44124e-08  unclonable  3.04117e-11 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  40.95 
 
 
442 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
446 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  9.2283e-06  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
446 aa  324  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.10874e-07  hitchhiker  1.76689e-09 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>