More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0075 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0075  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
118 aa  228  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.820764  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2065  50S ribosomal protein L18  89.83 
 
 
118 aa  211  4e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1688  50S ribosomal protein L18  88.98 
 
 
118 aa  209  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.949463  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1859  50S ribosomal protein L18  88.98 
 
 
118 aa  209  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1760  50S ribosomal protein L18  77.12 
 
 
118 aa  163  6e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1952  ribosomal protein L18  65.25 
 
 
118 aa  161  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0100  50S ribosomal protein L18  64.41 
 
 
118 aa  158  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1017  50S ribosomal protein L18  73.73 
 
 
118 aa  157  6e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000395061  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0050  50S ribosomal protein L18  72.88 
 
 
118 aa  154  5e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.341657  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0302  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 
118 aa  125  1e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.488983  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  53.57 
 
 
119 aa  108  2e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  51.4 
 
 
115 aa  107  6e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  50.46 
 
 
118 aa  106  9e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.95755e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
117 aa  104  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  50.93 
 
 
116 aa  103  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  47.32 
 
 
116 aa  101  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  48.62 
 
 
120 aa  101  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1558  ribosomal protein L18  54.95 
 
 
121 aa  100  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.83356e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  46.85 
 
 
119 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  50 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  45.54 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  44.54 
 
 
122 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.52303e-10 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  45.61 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  48.6 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  46.22 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  49.09 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  46.49 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  44.07 
 
 
121 aa  94  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.62342e-09  hitchhiker  3.24401e-08 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  51.85 
 
 
115 aa  93.6  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  44.95 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  44.74 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  46.36 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  42.98 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  42.34 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  46.36 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  44.04 
 
 
118 aa  92  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  43.75 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  42.98 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  43.1 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  42.5 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  44.14 
 
 
112 aa  89.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  44.25 
 
 
121 aa  89  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  45.54 
 
 
120 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  42.5 
 
 
136 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  6.97313e-06  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0505  50S ribosomal protein L18  47.37 
 
 
119 aa  88.2  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  41.28 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  2.57389e-05  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  41.32 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 
120 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  40.34 
 
 
124 aa  87.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  41.03 
 
 
117 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  44.44 
 
 
118 aa  87  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.579e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  46.39 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  45.87 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  45.87 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  42.2 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  44.07 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  1.28953e-05 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  42.11 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1362  ribosomal protein L18  43.59 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  44.54 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf425  ribosomal protein L18  45.74 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  42.34 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  41.67 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  42.11 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  39.34 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  44.14 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  42.48 
 
 
121 aa  83.2  1e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  41.38 
 
 
122 aa  82.8  1e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.55959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  41.82 
 
 
120 aa  82.4  2e-15  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  40.34 
 
 
122 aa  82.4  2e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  9.83895e-07 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  39.5 
 
 
122 aa  82  2e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  37.07 
 
 
123 aa  81.6  3e-15  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  47.75 
 
 
116 aa  82  3e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  41.59 
 
 
122 aa  81.6  4e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  41.44 
 
 
121 aa  81.3  4e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  42.86 
 
 
124 aa  80.9  6e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  38.66 
 
 
120 aa  80.9  6e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0270  50S ribosomal protein L18  43.48 
 
 
119 aa  80.9  6e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0524919  normal  0.432762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  38.66 
 
 
120 aa  80.9  6e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  36.75 
 
 
119 aa  80.5  7e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  44.44 
 
 
117 aa  80.5  8e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  43.24 
 
 
122 aa  79.7  1e-14  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1356  ribosomal protein L18  44.21 
 
 
117 aa  79.3  1e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  38.26 
 
 
124 aa  79.7  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_002620  TC0800  50S ribosomal protein L18  35.29 
 
 
123 aa  79  2e-14  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00718139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  38.66 
 
 
134 aa  79  2e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  2.55511e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
120 aa  79.3  2e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  36.61 
 
 
122 aa  78.6  2e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  38.26 
 
 
124 aa  79  2e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  39.32 
 
 
124 aa  78.6  2e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  8.38424e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  42.86 
 
 
122 aa  78.6  3e-14  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  39.5 
 
 
134 aa  78.6  3e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  43.12 
 
 
116 aa  78.6  3e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>