More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0073 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0073  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
131 aa  263  7e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.200652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1861  30S ribosomal protein S8  93.13 
 
 
131 aa  251  2e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1690  30S ribosomal protein S8  92.37 
 
 
131 aa  251  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0798562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2067  30S ribosomal protein S8  90.84 
 
 
131 aa  247  5e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0048  30S ribosomal protein S8  80.92 
 
 
131 aa  223  5e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.580266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1954  ribosomal protein S8  77.86 
 
 
131 aa  221  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1763  30S ribosomal protein S8  79.39 
 
 
131 aa  218  2e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00017341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0300  30S ribosomal protein S8  75.57 
 
 
131 aa  207  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.110485  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0098  30S ribosomal protein S8  73.28 
 
 
131 aa  206  6e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.578211  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1019  30S ribosomal protein S8  76.32 
 
 
114 aa  187  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000503612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
132 aa  129  1e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.99724e-13  hitchhiker  3.61155e-08 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  129  1e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  129  1e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  6.49182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
132 aa  126  8e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79299e-11 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
132 aa  126  8e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
132 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
132 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  45.8 
 
 
131 aa  120  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 
131 aa  120  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  45.38 
 
 
132 aa  120  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.76447e-06  hitchhiker  1.37084e-07 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  45.8 
 
 
134 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
131 aa  120  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  42.75 
 
 
131 aa  119  1e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  4.55878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  118  2e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  42.75 
 
 
131 aa  119  2e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  2.83482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2215  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  118  2e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.86287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  4.78289e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  41.54 
 
 
132 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.5487e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0195  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  117  4e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.344258  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
133 aa  117  4e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  41.98 
 
 
131 aa  117  5e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  7.1854e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
132 aa  117  5e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  3.37802e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2409  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
131 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0303  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  116  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
130 aa  115  1e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2282  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 
131 aa  116  1e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  2.28338e-08  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1837  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  116  1e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  41.54 
 
 
134 aa  116  1e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  45.38 
 
 
132 aa  115  2e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  115  2e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  43.51 
 
 
131 aa  115  2e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
132 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
132 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  6.31247e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  114  4e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  41.98 
 
 
131 aa  114  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
130 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  114  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0773  30S ribosomal protein S8  47.33 
 
 
132 aa  113  1e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590694  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  43.08 
 
 
133 aa  113  1e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  41.98 
 
 
132 aa  112  1e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  4.96692e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0566  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
132 aa  112  2e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  42.31 
 
 
132 aa  112  2e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  1.36856e-05 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
130 aa  112  2e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
126 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2155  ribosomal protein S8  45.04 
 
 
130 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0746711  normal  0.328935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0268  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
130 aa  111  4e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0501606  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  6.57656e-05  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.54136e-05  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  110  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.97619e-06  decreased coverage  1.24793e-12 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  40.77 
 
 
132 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2204  ribosomal protein S8  43.18 
 
 
131 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184093  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  110  7e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
131 aa  110  7e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.52194e-15  unclonable  4.69297e-08 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0674  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
126 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.973515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  109  1e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.09852e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
133 aa  109  1e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
126 aa  109  1e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.92873e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  3.92794e-07  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  1.061e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  1.28186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  109  1e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  108  2e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1368  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  108  2e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380373  normal  0.0838424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  108  2e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2520  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
132 aa  108  2e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0802  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
133 aa  108  2e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000681692  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  108  2e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
131 aa  108  2e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  3.15626e-07  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
131 aa  108  2e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.96885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  46.21 
 
 
133 aa  108  2e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  41.54 
 
 
132 aa  108  2e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  40.46 
 
 
132 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  7.64714e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0375  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1729  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  42.11 
 
 
133 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  42.64 
 
 
131 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  3.01121e-11  hitchhiker  2.01574e-06 
 
 
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  107  4e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  1.59627e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  41.98 
 
 
132 aa  107  4e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  9.78378e-10  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  40.46 
 
 
132 aa  107  4e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>