More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0072 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0072  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
61 aa  127  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.15286  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1764  30S ribosomal protein S14  96.72 
 
 
61 aa  124  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  8.26502e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0047  30S ribosomal protein S14  96.72 
 
 
61 aa  124  4e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.585329  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1955  ribosomal protein S14  95.08 
 
 
61 aa  123  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1020  30S ribosomal protein S14  95.08 
 
 
61 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00305455  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1862  30S ribosomal protein S14  95.08 
 
 
61 aa  121  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1691  30S ribosomal protein S14  95.08 
 
 
61 aa  121  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.049488  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2068  30S ribosomal protein S14  95.08 
 
 
61 aa  121  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0299  30S ribosomal protein S14  86.89 
 
 
61 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0322273  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0097  ribosomal protein S14p/S29e  88.52 
 
 
61 aa  113  1e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.316233  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2698  ribosomal protein S14  73.77 
 
 
61 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4494  ribosomal protein S14  72.13 
 
 
61 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23340  SSU ribosomal protein S14P  72.13 
 
 
61 aa  97.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  9.71203e-07  hitchhiker  1.3579e-07 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6036  30S ribosomal protein S14  70.49 
 
 
61 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0701  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0640  ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196162  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0600  ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.516663  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0319  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  95.9  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23670  SSU ribosomal protein S14P  68.85 
 
 
61 aa  96.3  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143448  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1045  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000910706  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1057  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  7.11569e-05  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1028  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  5.64921e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29610  SSU ribosomal protein S14P  67.21 
 
 
61 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.975596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0944  ribosomal protein S14  70.49 
 
 
61 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1136  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  94.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2646  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  94.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6601  ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  94.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1125  30S ribosomal protein S14  70.49 
 
 
61 aa  94.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.128542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0124  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04110  SSU ribosomal protein S14P  67.21 
 
 
61 aa  94.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3710  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4302  30S ribosomal protein S14  70.49 
 
 
61 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604005  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3910  30S ribosomal protein S14  70.49 
 
 
61 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229481  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0120  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1335  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  94  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  1.48473e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5034  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  5.80616e-05  normal  0.481269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3892  SSU ribosomal protein S14P  67.21 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0123  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.4934e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5182  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.20128e-09  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0117  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.49674e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0123  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.76609e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0119  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.68552e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0135  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0144  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.18552e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0154  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.46277e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3418  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0117  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.93701e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0118  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.9135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0123  30S ribosomal protein S14  68.85 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  5.15303e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1470  30S ribosomal protein S14  72.13 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.97211e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0595  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264a  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  92  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1148  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.24715e-07  hitchhiker  0.00150384 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0411  ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20740  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.905824 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1720  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  91.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf429  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  91.3  4e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1198  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0428154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09870  SSU ribosomal protein S14P  67.21 
 
 
61 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000893021  hitchhiker  1.77439e-05 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2633  SSU ribosomal protein S14P  65.57 
 
 
61 aa  90.5  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0670776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2165  ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  90.5  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0123488  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0575  30S ribosomal protein S14  67.21 
 
 
61 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5137  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  90.5  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.410721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2894  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  90.1  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0771  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.76242e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10731  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.606007 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1818  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2305  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00385731  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1405  ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2389  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  1.9589e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1561  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000971035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0966  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  89  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1894  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  88.6  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  7.9988e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2264  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00143207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4927  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  88.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  3.98171e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0071  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.689947  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0683  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 
61 aa  87.8  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0777  ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  87.8  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0435  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000657507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0207  SSU ribosomal protein S14P  59.02 
 
 
61 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00665329  normal  0.463134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3130  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2320  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  86.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.05328e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1099  ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2916  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0228  ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.29015e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl136  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  85.5  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1305  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  4.31164e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1381  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000700015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2386  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2701  30S ribosomal protein S14  59.02 
 
 
61 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0490  ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  85.1  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0863269  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0239  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  84.7  4e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1568  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 
61 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.837036  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1511  ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0340  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0510  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0183715  hitchhiker  3.49266e-10 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0880  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 
61 aa  82.4  2e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0502  30S ribosomal protein S14  60.66 
 
 
61 aa  82.4  2e-15  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0721  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 
61 aa  82  2e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0714  30S ribosomal protein S14  62.3 
 
 
61 aa  82.4  2e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000170249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>