More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0070 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0070  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
75 aa  143  8e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.033879  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1693  50S ribosomal protein L24  85.33 
 
 
77 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0105327  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1864  50S ribosomal protein L24  85.33 
 
 
77 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2070  50S ribosomal protein L24  84 
 
 
77 aa  123  8e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.419716  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0095  50S ribosomal protein L24  80 
 
 
76 aa  110  7e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.713288  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1766  50S ribosomal protein L24  73.61 
 
 
78 aa  108  2e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  9.67663e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1022  50S ribosomal protein L24  69.33 
 
 
78 aa  107  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000323194  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0045  50S ribosomal protein L24  76.39 
 
 
77 aa  106  8e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.74317  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1957  ribosomal protein L24  71.83 
 
 
78 aa  101  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0297  50S ribosomal protein L24  64.79 
 
 
76 aa  95.5  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00211526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  56.16 
 
 
80 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.23735e-08  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  53.62 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  54.93 
 
 
80 aa  83.2  1e-15  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  54.79 
 
 
80 aa  81.6  4e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  7.49977e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  53.62 
 
 
106 aa  81.3  5e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.32884e-06  hitchhiker  1.26153e-07 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 
80 aa  80.1  9e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  5.67909e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  56.34 
 
 
104 aa  80.1  1e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.03774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.36575e-10  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79.3  2e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07051e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79.3  2e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.11062e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.27512e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.84056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.77787e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09018e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.45325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
103 aa  79  2e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.83187e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 
106 aa  78.2  3e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  54.93 
 
 
104 aa  77  9e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  5.30898e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  51.43 
 
 
112 aa  74.7  4e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 
80 aa  74.3  5e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 
106 aa  74.3  5e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  49.32 
 
 
80 aa  74.3  6e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  54.29 
 
 
105 aa  73.9  6e-13  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.01536e-07  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  48.53 
 
 
104 aa  72.8  1e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 
105 aa  72.4  2e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  48.57 
 
 
109 aa  72.4  2e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.97674e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 
105 aa  72.4  2e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  53.03 
 
 
101 aa  71.2  4e-12  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.23185e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  53.52 
 
 
105 aa  71.2  5e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
115 aa  70.5  8e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 
105 aa  70.1  9e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 
112 aa  69.7  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
115 aa  69.7  1e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 
101 aa  69.3  2e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  4.985e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
105 aa  68.9  2e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 
101 aa  68.9  2e-11  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
104 aa  68.2  3e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 
106 aa  68.6  3e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  46.48 
 
 
106 aa  68.2  3e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
104 aa  68.6  3e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  49.28 
 
 
113 aa  68.6  3e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
118 aa  68.6  3e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  50 
 
 
109 aa  67.8  4e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  45.59 
 
 
103 aa  67.8  5e-11  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 
108 aa  67.8  5e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  48.61 
 
 
109 aa  67.8  5e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  3.38096e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0925  KOW domain protein  50.67 
 
 
75 aa  67.8  5e-11  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  6.00412e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
118 aa  67.8  5e-11  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  49.3 
 
 
106 aa  67.4  6e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 
108 aa  67.4  6e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 
116 aa  67.4  7e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.40948e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 
102 aa  67  8e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.19742e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  52.94 
 
 
89 aa  67  8e-11  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  1.25199e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 
110 aa  66.2  1e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  2.98754e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  44.12 
 
 
103 aa  66.6  1e-10  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.82756e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 
103 aa  66.6  1e-10  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  7.81328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
115 aa  66.2  1e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
106 aa  65.9  2e-10  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  52.11 
 
 
107 aa  65.5  2e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 
118 aa  65.9  2e-10  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  44.29 
 
 
118 aa  65.5  2e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
107 aa  65.5  2e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47.83 
 
 
107 aa  65.9  2e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79299e-11 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  47.14 
 
 
118 aa  65.5  3e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  47.83 
 
 
106 aa  65.1  3e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  56.72 
 
 
105 aa  65.5  3e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.60911e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  47.95 
 
 
105 aa  65.5  3e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 
107 aa  64.7  4e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.72359e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 
107 aa  64.7  4e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  64.3  5e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  64.3  5e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.35301e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  45.59 
 
 
113 aa  64.7  5e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  64.3  6e-10  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  51.47 
 
 
106 aa  64.3  6e-10  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  49.3 
 
 
101 aa  63.9  7e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  45.07 
 
 
104 aa  63.9  7e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  47.89 
 
 
101 aa  63.9  8e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  47.89 
 
 
101 aa  63.9  8e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  47.89 
 
 
101 aa  63.9  8e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  46.38 
 
 
106 aa  63.5  9e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  3.13767e-10 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  46.38 
 
 
117 aa  63.5  9e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.92817e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  46.58 
 
 
105 aa  63.5  9e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  7.60345e-07  unclonable  2.81859e-10 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  43.48 
 
 
106 aa  63.5  9e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.32797e-05  normal  0.0989855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>