More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0068 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0068  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
83 aa  166  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00143996  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1866  30S ribosomal protein S17  83.13 
 
 
83 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1695  30S ribosomal protein S17  83.13 
 
 
83 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2072  30S ribosomal protein S17  83.13 
 
 
83 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0741725  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1024  30S ribosomal protein S17  74.7 
 
 
83 aa  135  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00110885  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1768  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 
83 aa  133  6e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000123557  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1959  30S ribosomal protein S17  75.9 
 
 
83 aa  134  6e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.493665  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0093  30S ribosomal protein S17  71.08 
 
 
83 aa  132  2e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.854  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0043  30S ribosomal protein S17  71.6 
 
 
85 aa  128  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.183118  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0295  30S ribosomal protein S17  73.08 
 
 
82 aa  126  1e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  56.34 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  52 
 
 
86 aa  79  2e-14  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  52.78 
 
 
88 aa  77  7e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  3.37654e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  49.28 
 
 
92 aa  75.1  3e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  51.43 
 
 
87 aa  75.1  3e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
87 aa  74.7  4e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  50 
 
 
83 aa  74.7  4e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.49571e-05  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
97 aa  74.3  5e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  48.68 
 
 
120 aa  73.6  9e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  50.67 
 
 
89 aa  73.6  9e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  48 
 
 
101 aa  73.2  1e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  8.54587e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  48.68 
 
 
82 aa  71.6  3e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  48 
 
 
94 aa  71.6  4e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  46.67 
 
 
83 aa  71.2  4e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  3.90975e-05  hitchhiker  9.87028e-07 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  54.55 
 
 
85 aa  71.6  4e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  51.43 
 
 
86 aa  70.9  5e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 
90 aa  71.2  5e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.25562e-08  hitchhiker  1.71329e-06 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  50.72 
 
 
90 aa  70.9  5e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
87 aa  71.2  5e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
86 aa  70.9  6e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  43.42 
 
 
94 aa  70.5  8e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  48.68 
 
 
107 aa  69.7  1e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  6.54359e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  49.35 
 
 
78 aa  69.7  1e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
86 aa  69.7  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  2.0777e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  43.59 
 
 
91 aa  69.7  1e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  2.46265e-10 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  51.35 
 
 
94 aa  69.7  1e-11  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 
82 aa  69.7  1e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.14051e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  43.21 
 
 
85 aa  69.7  1e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
79 aa  69.7  1e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  43.59 
 
 
91 aa  69.7  1e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  48 
 
 
82 aa  70.1  1e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.15651e-08  unclonable  4.30661e-11 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  43.21 
 
 
85 aa  69.3  2e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  47.14 
 
 
84 aa  69.3  2e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
86 aa  69.3  2e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
79 aa  69.3  2e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
79 aa  69.3  2e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  47.89 
 
 
76 aa  68.9  2e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  53.52 
 
 
84 aa  68.9  2e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.5143e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 
82 aa  69.3  2e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  8.64007e-09  unclonable  1.12365e-08 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
88 aa  68.9  2e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  48.57 
 
 
99 aa  68.9  2e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
78 aa  68.6  3e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 
85 aa  68.6  3e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  52.17 
 
 
82 aa  68.6  3e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  8.88762e-09  hitchhiker  3.86563e-09 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  48 
 
 
83 aa  68.6  3e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 
82 aa  68.6  3e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  3.50413e-08  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
89 aa  68.2  4e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0304  ribosomal protein S17  42.47 
 
 
87 aa  67.8  4e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000983019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  68.2  4e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
88 aa  68.2  4e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
89 aa  68.2  4e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
88 aa  68.2  4e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  47.5 
 
 
85 aa  68.2  4e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  48 
 
 
88 aa  68.2  4e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.52405e-29 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  48 
 
 
82 aa  67.8  5e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.59917e-09  hitchhiker  1.1379e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  48 
 
 
82 aa  67.8  5e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.4726e-08  unclonable  1.49425e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  48 
 
 
82 aa  67.8  5e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  2.79278e-06  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  48 
 
 
82 aa  67.8  5e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  41.98 
 
 
88 aa  67.8  5e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  4.32201e-08 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  67.4  6e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  47.22 
 
 
85 aa  67  7e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78242e-12 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1152  ribosomal protein S17  48.57 
 
 
88 aa  67.4  7e-11  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.41067e-07  hitchhiker  2.6776e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  67  8e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
89 aa  67  8e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  7.40755e-07  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  67  8e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 
82 aa  66.2  1e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  7.7178e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  48.57 
 
 
86 aa  66.2  1e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  9.9877e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 
82 aa  66.2  1e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.8185e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_9992  Putative mitochondrial ribosomal protein S17  48.61 
 
 
72 aa  66.6  1e-10  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0440902  normal  0.0185342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 
82 aa  66.2  1e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.39872e-06  unclonable  7.94162e-06 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  50.7 
 
 
101 aa  66.2  1e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  2.64542e-06 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 
79 aa  66.6  1e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  47.37 
 
 
107 aa  66.2  1e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  7.61749e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 
82 aa  66.2  1e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.79685e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 
97 aa  66.6  1e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  1.73593e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 
82 aa  66.2  1e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.00461e-09  unclonable  3.80928e-12 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  47.3 
 
 
84 aa  66.2  1e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 
85 aa  66.2  1e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  4.77154e-05  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  44 
 
 
82 aa  66.6  1e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.17396e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  44 
 
 
82 aa  65.5  2e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.65086e-13  n/a   
 
 
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
80 aa  65.9  2e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  47.89 
 
 
89 aa  65.5  2e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  2.77089e-08 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2160  30S ribosomal protein S17  45.33 
 
 
88 aa  65.9  2e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0103749  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  47.37 
 
 
78 aa  65.5  2e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
92 aa  65.9  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.82432e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
80 aa  65.9  2e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>