59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0067 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0067  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
61 aa  118  2e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00273848  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1696  50S ribosomal protein L29  91.8 
 
 
61 aa  111  4e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00133107  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1867  50S ribosomal protein L29  91.8 
 
 
61 aa  111  4e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2073  50S ribosomal protein L29  91.8 
 
 
61 aa  111  4e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0466832  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1960  ribosomal protein L29  77.97 
 
 
62 aa  94.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.430573  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1769  50S ribosomal protein L29  77.97 
 
 
64 aa  94.4  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000104669  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0042  50S ribosomal protein L29  77.05 
 
 
61 aa  91.3  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1025  50S ribosomal protein L29  75.41 
 
 
61 aa  90.9  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00341949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0294  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
61 aa  63.9  6e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00124097  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0092  50S ribosomal protein L29  73.77 
 
 
61 aa  54.3  5e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.786092  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  47.27 
 
 
71 aa  50.8  6e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.0056e-07  hitchhiker  2.41726e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  45.76 
 
 
64 aa  50.4  7e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  45.76 
 
 
69 aa  50.4  9e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.27538e-06  hitchhiker  8.55419e-07 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  45.76 
 
 
64 aa  49.7  1e-05  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  1.5632e-06 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
88 aa  48.5  3e-05  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 
65 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.55433e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.02541e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  50.91 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.40424e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.46597e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.6255e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.70217e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  5.49386e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.08927e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.92079e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.15107e-10  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.25905e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.29957e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  43.64 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  47.27 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  43.86 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  45.1 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  44.44 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  44.64 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0287  50S ribosomal protein L29P  36.21 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  8.66901e-09  hitchhiker  1.64935e-06 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.69135e-08  hitchhiker  3.34263e-09 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  2.58995e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 
68 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  45.45 
 
 
65 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  42.11 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3455  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  2.52439e-08  decreased coverage  0.00364799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0284  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.04837e-08  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0335  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000122941  normal  0.019257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0257  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00213265  normal  0.0167068 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2751  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  3.61638e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0356  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.00225e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0275  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  4.76905e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  41.51 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  44.07 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0327  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 
64 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.65874e-22  unclonable  3.98692e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>