More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0066 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  97.87 
 
 
141 aa  283  7e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  97.87 
 
 
141 aa  283  7e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  97.87 
 
 
141 aa  283  7e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0041  50S ribosomal protein L16  81.56 
 
 
141 aa  247  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.123597  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1026  50S ribosomal protein L16  82.27 
 
 
141 aa  245  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00185253  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1770  50S ribosomal protein L16  82.27 
 
 
141 aa  245  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  3.06557e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  80.14 
 
 
141 aa  238  3e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0091  50S ribosomal protein L16  77.3 
 
 
141 aa  234  3e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.453795  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0293  50S ribosomal protein L16  78.01 
 
 
141 aa  231  2e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 
140 aa  198  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 
140 aa  198  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47904e-12 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 
140 aa  195  2e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 
140 aa  194  5e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  64.75 
 
 
140 aa  193  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 
137 aa  191  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  64.03 
 
 
140 aa  191  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.19005e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0302  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 
137 aa  191  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00320104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 
140 aa  190  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.66771e-08  hitchhiker  4.46584e-09 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  66.42 
 
 
144 aa  189  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0191  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
136 aa  189  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.39067e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 
137 aa  189  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  1.06632e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0165  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  187  3e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.00282e-07  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 
145 aa  186  6e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 
137 aa  184  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 
138 aa  184  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  62.96 
 
 
144 aa  184  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 
138 aa  183  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001735  LSU ribosomal protein L16p (L10e)  65.93 
 
 
136 aa  183  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.45291e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00737  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
136 aa  183  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 
138 aa  182  1e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0327  50S ribosomal protein L16  65.93 
 
 
136 aa  182  1e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000295305  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 
138 aa  182  1e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 
138 aa  182  1e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0726  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 
137 aa  182  1e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00162053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0155  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
136 aa  182  1e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.3379e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0177  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
136 aa  182  1e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.45989e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 
139 aa  182  1e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 
137 aa  181  2e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0401  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 
137 aa  181  2e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0376  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 
137 aa  181  2e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 
136 aa  182  2e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.59558e-09  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3815  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.19502e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 
141 aa  181  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.40858e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  59.29 
 
 
144 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  59.29 
 
 
144 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  63.7 
 
 
144 aa  181  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0476  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0462501  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0496  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 
137 aa  181  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  8.77255e-09  hitchhiker  0.00385796 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3994  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0400  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  4e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  6.14919e-05  hitchhiker  6.83618e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3608  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  4e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.49796e-06  normal  0.0156267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0330  ribosomal protein L16  62.69 
 
 
137 aa  181  4e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.39211e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03164  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  4e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00234681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0220  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
136 aa  181  4e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  8.96692e-10  unclonable  7.08625e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3698  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  4e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.49988e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3796  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  4e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.88504e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03115  hypothetical protein  67.16 
 
 
136 aa  181  4e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00186538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3507  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  4e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.43497e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4636  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  4e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  6.0598e-06  normal  0.151194 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2167  50S ribosomal protein L16  65.19 
 
 
136 aa  181  4e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.12231e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3744  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  4e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.01532e-07  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 
144 aa  181  4e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0400  ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  181  4e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.22385e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2317  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 
137 aa  180  5e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0179145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0412  ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  180  5e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0307436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0491  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 
137 aa  180  5e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  4.19023e-07  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0433  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 
137 aa  180  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.74852e-11  hitchhiker  2.47561e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0330  ribosomal protein L16  67.16 
 
 
136 aa  180  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  9.7682e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2317  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 
137 aa  179  8e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.21172e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  61.87 
 
 
140 aa  179  8e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4310  50S ribosomal protein L16  68.66 
 
 
136 aa  179  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  4.02503e-07  unclonable  4.62981e-11 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 
145 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.94235e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00452  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
136 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0232467  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3800  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
136 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0333969  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3629  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
136 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.50628e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3702  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
136 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3737  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
136 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980625  normal  0.023864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3629  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
136 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183832  normal  0.899526 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2162  ribosomal protein L16  62.22 
 
 
137 aa  178  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00554254  normal  0.180391 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  60.87 
 
 
144 aa  178  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3908  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 
136 aa  177  3e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.57151e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  59.71 
 
 
141 aa  177  3e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  57.55 
 
 
139 aa  177  3e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 
139 aa  178  3e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0290  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 
136 aa  177  3e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.62666e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0591  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 
136 aa  177  3e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.46592e-08  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4683  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 
136 aa  177  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.84582e-05  unclonable  1.32516e-08 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 
140 aa  176  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  59.42 
 
 
151 aa  176  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0504  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
138 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  2.43822e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0334  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 
138 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  60 
 
 
144 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  7.52115e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  62.22 
 
 
144 aa  174  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.78104e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  59.71 
 
 
139 aa  174  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  58.99 
 
 
140 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 
142 aa  174  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 
140 aa  174  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 
139 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  59.85 
 
 
139 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>