More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0062 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0062  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
276 aa  559  1e-158  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.24196e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1872  50S ribosomal protein L2  95.29 
 
 
276 aa  539  1e-152  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.701919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1701  50S ribosomal protein L2  94.93 
 
 
276 aa  538  1e-152  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  3.71548e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2078  50S ribosomal protein L2  94.57 
 
 
276 aa  535  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  4.77294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  87.68 
 
 
276 aa  501  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0352  50S ribosomal protein L2  88.09 
 
 
277 aa  498  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  1.47687e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1029  50S ribosomal protein L2  86.64 
 
 
277 aa  494  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000494173  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1965  ribosomal protein L2  82.97 
 
 
276 aa  460  1e-128  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000977898  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0087  50S ribosomal protein L2  81.16 
 
 
276 aa  452  1e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.025242  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0289  50S ribosomal protein L2  78.47 
 
 
279 aa  449  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  62.32 
 
 
276 aa  338  6e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  5.61637e-06  decreased coverage  1.03379e-08 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  60.44 
 
 
274 aa  335  4e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  62.32 
 
 
276 aa  334  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  61.59 
 
 
276 aa  332  3e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  1.65173e-06 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 
277 aa  328  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
275 aa  327  1e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  61.51 
 
 
275 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 
275 aa  323  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  60 
 
 
276 aa  323  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 
276 aa  322  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  60.71 
 
 
277 aa  321  8e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.99614e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  60.71 
 
 
277 aa  321  8e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.90927e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  320  1e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  319  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.90971e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 
275 aa  319  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.5035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
277 aa  318  5e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  58.27 
 
 
278 aa  317  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.62145e-06  hitchhiker  6.63071e-07 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 
276 aa  316  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  58.63 
 
 
277 aa  316  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
274 aa  316  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.33663e-07  hitchhiker  8.56838e-12 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  59.29 
 
 
277 aa  316  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
277 aa  316  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
277 aa  316  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 
276 aa  315  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.87869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  61.01 
 
 
276 aa  315  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.04251e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
274 aa  315  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.47453e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  61.01 
 
 
276 aa  315  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.49417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  61.01 
 
 
276 aa  315  6e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.80933e-09  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  59.12 
 
 
275 aa  314  8e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
276 aa  314  1e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.00839e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
276 aa  314  1e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.12601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
276 aa  314  1e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
276 aa  314  1e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.01221e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
276 aa  314  1e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38046e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 
273 aa  313  1e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.50454e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
276 aa  314  1e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.00516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
276 aa  314  1e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
280 aa  312  4e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  58.57 
 
 
279 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 
274 aa  308  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 
279 aa  308  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
277 aa  308  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  1.30499e-05 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  58.61 
 
 
274 aa  308  6e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
274 aa  308  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.4248e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
274 aa  307  1e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29312e-15 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 
276 aa  307  2e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 
274 aa  306  2e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 
274 aa  306  2e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.0829e-09  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 
274 aa  306  2e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  58.97 
 
 
274 aa  307  2e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 
274 aa  306  2e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.15964e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 
273 aa  306  2e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0989  50S ribosomal protein L2  56.78 
 
 
278 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.0318056 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  59.21 
 
 
276 aa  305  4e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.10614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 
276 aa  305  5e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  58.72 
 
 
281 aa  305  7e-82  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 
276 aa  305  7e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 
273 aa  304  9e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 
273 aa  304  9e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 
279 aa  304  1e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  56.36 
 
 
273 aa  304  1e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.57775e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  56.36 
 
 
273 aa  304  1e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  56.36 
 
 
273 aa  304  1e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 
274 aa  304  1e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.06039e-07  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  56.36 
 
 
273 aa  304  1e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.37187e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  56.36 
 
 
273 aa  304  1e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.2222e-06  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 
279 aa  304  1e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  56.36 
 
 
273 aa  304  1e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  56.36 
 
 
273 aa  304  1e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.12597e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  56.36 
 
 
273 aa  304  1e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.01214e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  56.36 
 
 
273 aa  304  1e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 
279 aa  304  1e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 
287 aa  304  1e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  56.27 
 
 
281 aa  303  2e-81  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0461  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 
274 aa  303  2e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1792  50S ribosomal protein L2  56.78 
 
 
278 aa  303  3e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109634  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  56.36 
 
 
273 aa  302  4e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.91678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  58.51 
 
 
281 aa  302  4e-81  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1843  50S ribosomal protein L2  55.43 
 
 
278 aa  301  5e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0328595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 
276 aa  301  6e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1335  50S ribosomal protein L2  56.78 
 
 
278 aa  301  6e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0836019 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  56.32 
 
 
275 aa  301  7e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  59.35 
 
 
281 aa  301  9e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.72816e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  56 
 
 
273 aa  301  9e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1433  50S ribosomal protein L2  56.41 
 
 
278 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  0.0219433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  55.6 
 
 
287 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 
276 aa  300  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  55.64 
 
 
273 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1675  50S ribosomal protein L2  56.41 
 
 
278 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 
275 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.31539e-08  normal  0.228916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>