More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0058 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0058  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
103 aa  206  7e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  3.17741e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0033  30S ribosomal protein S10  98.06 
 
 
103 aa  205  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1876  30S ribosomal protein S10  97.09 
 
 
103 aa  202  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.000570369  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0002  30S ribosomal protein S10  97.09 
 
 
103 aa  202  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  5.72155e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2236  30S ribosomal protein S10  98.02 
 
 
126 aa  202  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  1.96356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2082  30S ribosomal protein S10  96.12 
 
 
103 aa  202  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  3.64136e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2327  30S ribosomal protein S10  98.02 
 
 
112 aa  200  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  1.87948e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0083  30S ribosomal protein S10  93.2 
 
 
103 aa  199  8e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  5.83291e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1969  ribosomal protein S10  88.35 
 
 
103 aa  188  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  9.60204e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0285  30S ribosomal protein S10  79.61 
 
 
103 aa  175  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00476788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  63.27 
 
 
103 aa  141  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.64723e-06  decreased coverage  9.47215e-06 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  61.39 
 
 
104 aa  132  1e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  130  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  130  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  130  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  130  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  130  7e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  7e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  7e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  7e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  8e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  8e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  59.18 
 
 
103 aa  130  8e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  8e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  8e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  8e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  8e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  130  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  4.49756e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
103 aa  129  1e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  6.33059e-05  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  129  1e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  5.81864e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  129  1e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.32715e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  129  1e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  128  2e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  129  2e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  129  2e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  129  2e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  129  2e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  128  2e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  128  2e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  129  2e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 
103 aa  127  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  2.3421e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  55.1 
 
 
101 aa  127  4e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
103 aa  127  4e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  55.67 
 
 
103 aa  127  4e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  8.38307e-09  unclonable  2.16996e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  55.67 
 
 
103 aa  127  4e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.42072e-07  unclonable  4.77389e-11 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  55.67 
 
 
103 aa  127  4e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.40291e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  55.1 
 
 
101 aa  127  4e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  55.1 
 
 
101 aa  127  4e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  127  4e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  55.1 
 
 
101 aa  127  4e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  127  5e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.67319e-09  hitchhiker  1.3297e-09 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  127  5e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.55753e-09  decreased coverage  4.48668e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  127  5e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0193  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  127  5e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  4.24599e-06  decreased coverage  0.00027939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0198  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  127  5e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.00655e-07  unclonable  1.57318e-11 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  55.1 
 
 
102 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0199  30S ribosomal protein S10  55.67 
 
 
103 aa  127  7e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.81945e-08  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0195  30S ribosomal protein S10  55.67 
 
 
103 aa  127  7e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  6.45818e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3760  30S ribosomal protein S10  55.67 
 
 
103 aa  127  7e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.631e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
104 aa  127  7e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4171  30S ribosomal protein S10  55.67 
 
 
103 aa  127  7e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.85608e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4057  30S ribosomal protein S10  55.67 
 
 
103 aa  127  7e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.79961e-09  hitchhiker  1.38432e-10 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0147  ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  127  7e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  4.95355e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4545  ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.55488e-10  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0282  ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  7.46506e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3823  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.46327e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3745  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00135486  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3808  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  6.4612e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0583  ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.72032e-08  normal  0.180599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3637  ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.69105e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0404  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0007092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3710  ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000120586  normal  0.692874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  55.67 
 
 
103 aa  126  8e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  4.57129e-06  hitchhiker  3.21241e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3637  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.84006e-08  normal  0.459498 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3916  ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.06232e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0322  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.2719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4002  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  6.61379e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0058  SSU ribosomal protein S10P  56.7 
 
 
103 aa  126  8e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  4.15336e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
105 aa  126  9e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  1.45478e-12  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0755  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
103 aa  126  9e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  5.08535e-12  normal  0.0162488 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0425  30S ribosomal protein S10  56.44 
 
 
103 aa  126  9e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.01436e-12  hitchhiker  2.76478e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  55.67 
 
 
103 aa  126  1e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.77123e-10  unclonable  6.93674e-06 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3752  SSU ribosomal protein S10P  55.67 
 
 
103 aa  126  1e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  6.21266e-07  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3910  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  126  1e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00375138  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06240  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  126  1e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00394017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0486  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  1.31122e-07  normal  0.0380301 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0392  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.44875e-06  hitchhiker  0.00689004 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3616  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.87491e-08  hitchhiker  0.00493043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4549  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000213954  normal  0.0597614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08840  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.52676e-05  normal  0.0199275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03172  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00056658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0836  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0236552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4750  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  6.71466e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3706  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.00932e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0625  ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  4.66292e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5080  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  125  2e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  7.93453e-11  normal  0.270334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>