70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0055 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0055  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  100 
 
 
235 aa  468  1e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  3.59095e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1517  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  54.81 
 
 
243 aa  253  1e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1885  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  54.58 
 
 
244 aa  253  1e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1703  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  54.39 
 
 
243 aa  251  7e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00443549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0073  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  43.78 
 
 
239 aa  195  5e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1770  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  43.44 
 
 
223 aa  182  5e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1179  hypothetical protein  36.65 
 
 
330 aa  132  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03942  uncharacterized FlgJ-related protein  35.63 
 
 
250 aa  114  1e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2128  hypothetical protein  32.89 
 
 
294 aa  111  1e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4482  Bax domain-containing protein  34.42 
 
 
297 aa  110  2e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  32.23 
 
 
270 aa  109  4e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  32.23 
 
 
270 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.11011e-06  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  32.23 
 
 
270 aa  108  8e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  32.23 
 
 
270 aa  108  8e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  32.23 
 
 
270 aa  108  8e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.1 
 
 
270 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  30.1 
 
 
270 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  30.1 
 
 
270 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  5.56975e-08 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0684  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.88 
 
 
320 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0161528  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  30.1 
 
 
270 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0978  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  32.56 
 
 
354 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00771467  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  41.79 
 
 
267 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  29.76 
 
 
255 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  41.48 
 
 
304 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  32.77 
 
 
245 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  47.57 
 
 
237 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3701  bax protein, putative  33.18 
 
 
301 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3159  uncharacterized FlgJ-related protein-like  33.18 
 
 
353 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  44.44 
 
 
310 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2111  transcriptional regulator, Fis family protein  33.64 
 
 
309 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  normal  0.43033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  38.06 
 
 
259 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  32.69 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0872  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  32.09 
 
 
342 aa  99  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.95 
 
 
286 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  27.8 
 
 
290 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1338  hypothetical protein  39.23 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  28.16 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  26.67 
 
 
272 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2975  putative bax protein  33.33 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  35.07 
 
 
290 aa  92.8  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  29.52 
 
 
275 aa  91.7  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  32.62 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3158e-05 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2496  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.78 
 
 
293 aa  75.5  7e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1243  putative exported amidase  33.76 
 
 
302 aa  72.4  6e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0417  BAX protein  33.82 
 
 
322 aa  72  8e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3268  BAX protein  31.3 
 
 
307 aa  70.9  2e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0422  BAX protein  33.09 
 
 
174 aa  70.5  2e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4894  hypothetical protein  35.38 
 
 
228 aa  67.4  2e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3941  hypothetical protein  31.25 
 
 
307 aa  65.1  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3986  hypothetical protein  31.25 
 
 
307 aa  65.1  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3860  hypothetical protein  31.25 
 
 
307 aa  65.1  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3877  hypothetical protein  31.25 
 
 
307 aa  65.1  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4046  hypothetical protein  31.25 
 
 
307 aa  65.1  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0151  hypothetical protein  29.13 
 
 
278 aa  63.2  3e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3952  hypothetical protein  29.92 
 
 
274 aa  62.4  6e-09  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03373  hypothetical protein  29.92 
 
 
274 aa  62.4  6e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3893  hypothetical protein  29.92 
 
 
274 aa  62.4  6e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0140  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.92 
 
 
274 aa  62.4  6e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03422  hypothetical protein  29.92 
 
 
274 aa  62.4  6e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3773  hypothetical protein  29.92 
 
 
274 aa  62.4  6e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4066  hypothetical protein  29.92 
 
 
274 aa  62.4  6e-09  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0144  hypothetical protein  29.92 
 
 
274 aa  62.4  6e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4946  hypothetical protein  29.92 
 
 
274 aa  62.4  7e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.481244  normal  0.092226 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1448  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.85 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.81 
 
 
619 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.81 
 
 
619 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0071  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.71 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.616993  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00645  hemagglutinin  30.28 
 
 
283 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0564  N-acetylmuramidase  31.65 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  4.7381e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>