More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0050 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0050  superoxide dismutase (Fe)  100 
 
 
217 aa  453  1e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.408378  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0164  superoxide dismutase, Fe  84.55 
 
 
220 aa  388  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0205  superoxide dismutase, Fe  84.55 
 
 
220 aa  388  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.570423  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0184  superoxide dismutase, Fe  83.18 
 
 
220 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0328  superoxide dismutase (Fe)  61.21 
 
 
205 aa  271  8e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.731602  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0032  superoxide dismutase(Fe)  60.09 
 
 
216 aa  260  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  1.79018e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1312  superoxide dismutase (Fe)  59.35 
 
 
216 aa  258  5e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  1.8669e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0365  superoxide dismutase (Fe)  57.67 
 
 
214 aa  253  2e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00134609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  56.25 
 
 
193 aa  220  1e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  56.25 
 
 
193 aa  220  1e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.39054e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  56.25 
 
 
193 aa  220  1e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  56.25 
 
 
193 aa  220  1e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  56.25 
 
 
193 aa  220  1e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  56.25 
 
 
193 aa  220  1e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.11005e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  56.25 
 
 
193 aa  220  1e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  56.25 
 
 
193 aa  220  1e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  56.25 
 
 
193 aa  220  1e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  54.69 
 
 
193 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  55.21 
 
 
193 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  55.21 
 
 
193 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  55.21 
 
 
193 aa  216  3e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.40254e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  55.21 
 
 
193 aa  216  3e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  53.65 
 
 
192 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  53.65 
 
 
192 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.9091e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  54.17 
 
 
233 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  54.17 
 
 
233 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  53.12 
 
 
192 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  52.06 
 
 
193 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  52.06 
 
 
193 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  51.03 
 
 
193 aa  204  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  52.06 
 
 
193 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  51.55 
 
 
193 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  51.81 
 
 
192 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  2.429e-05  hitchhiker  1.11544e-06 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  51.81 
 
 
193 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  51.31 
 
 
193 aa  202  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  51.55 
 
 
193 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  51.28 
 
 
198 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  53.37 
 
 
199 aa  201  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  50.77 
 
 
198 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  50.77 
 
 
198 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  53.37 
 
 
194 aa  201  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.74974e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  50.26 
 
 
198 aa  201  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  53.09 
 
 
193 aa  200  1e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  49.74 
 
 
198 aa  199  2e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  49.48 
 
 
192 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2196  superoxide dismutase  51.04 
 
 
192 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  hitchhiker  5.76689e-06 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  49.74 
 
 
193 aa  197  1e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  48.95 
 
 
221 aa  197  1e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  49.74 
 
 
193 aa  197  1e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2526  superoxide dismutase [Fe] protein  52.6 
 
 
192 aa  196  2e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0270769 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  52.08 
 
 
192 aa  196  2e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  49.48 
 
 
192 aa  196  2e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  48.42 
 
 
221 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  48.44 
 
 
192 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  48.44 
 
 
192 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  48.96 
 
 
192 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  48.44 
 
 
192 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  48.44 
 
 
192 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  48.44 
 
 
192 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  51.31 
 
 
193 aa  195  4e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.05445e-15  hitchhiker  6.30572e-06 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  48.42 
 
 
221 aa  195  4e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1791  superoxide dismutase  53.61 
 
 
193 aa  194  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.027396 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1129  superoxide dismutase  48.98 
 
 
225 aa  194  6e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0395543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  50.78 
 
 
193 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  50.77 
 
 
194 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  4.73936e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  48.42 
 
 
192 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  48.42 
 
 
192 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  48.42 
 
 
192 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  51.3 
 
 
194 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.40787e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  49.74 
 
 
193 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  51.83 
 
 
194 aa  192  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  48.44 
 
 
192 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  48.42 
 
 
192 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  48.42 
 
 
192 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  48.42 
 
 
192 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  47.92 
 
 
192 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2448  superoxide dismutase  49.74 
 
 
193 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103073  normal  0.0475458 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1858  superoxide dismutase [Fe]  52.36 
 
 
194 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  47.92 
 
 
192 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  49.74 
 
 
194 aa  188  6e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  50.26 
 
 
194 aa  187  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  50.26 
 
 
194 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  49.74 
 
 
194 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.80024e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  48.21 
 
 
193 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  49.74 
 
 
194 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.89489e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  49.74 
 
 
194 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.21956e-07  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  49.74 
 
 
194 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.39358e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  49.74 
 
 
194 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.20942e-09  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1395  superoxide dismutase  48.19 
 
 
193 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  49.74 
 
 
194 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.41638e-07  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  49.74 
 
 
194 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.80978e-09  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  49.23 
 
 
194 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  4.04322e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  48.95 
 
 
192 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  47.29 
 
 
200 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  48.69 
 
 
194 aa  183  2e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  46.23 
 
 
209 aa  181  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.00167e-10  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1834  superoxide dismutase  48.69 
 
 
194 aa  181  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.10112e-08  normal  0.958041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1639  superoxide dismutase  49.74 
 
 
194 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.40033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4998  Superoxide dismutase  46.07 
 
 
193 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  48.68 
 
 
193 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>