91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0047 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  100 
 
 
204 aa  418  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  53.27 
 
 
200 aa  230  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  41.23 
 
 
898 aa  166  3e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  39.06 
 
 
857 aa  158  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.28029e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  44.09 
 
 
486 aa  155  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.91799e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  41.01 
 
 
754 aa  152  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.09151e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  42.47 
 
 
800 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  39.62 
 
 
741 aa  148  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  39.62 
 
 
774 aa  148  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  40.96 
 
 
762 aa  147  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  40.61 
 
 
862 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  38.03 
 
 
862 aa  140  2e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.22963e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  38.38 
 
 
609 aa  137  9e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  41.55 
 
 
1038 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  50 
 
 
560 aa  130  1e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  36.69 
 
 
250 aa  129  2e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  35.08 
 
 
395 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  39.86 
 
 
250 aa  129  4e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  32.92 
 
 
789 aa  127  1e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.31268e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  40.14 
 
 
251 aa  125  3e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  32.62 
 
 
467 aa  123  2e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  41.22 
 
 
497 aa  119  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  38.73 
 
 
300 aa  118  7e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  40 
 
 
934 aa  117  8e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  37.58 
 
 
226 aa  117  2e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  35.09 
 
 
1214 aa  116  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  35.57 
 
 
2670 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  32.83 
 
 
272 aa  114  1e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  49.21 
 
 
219 aa  111  7e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  35.76 
 
 
323 aa  111  7e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  38.24 
 
 
173 aa  110  1e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  35.46 
 
 
399 aa  109  2e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  30.69 
 
 
907 aa  109  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.50893e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  35.82 
 
 
414 aa  107  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  33.33 
 
 
2415 aa  107  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  32.87 
 
 
427 aa  106  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  30.5 
 
 
933 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  37.4 
 
 
226 aa  105  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  34.85 
 
 
377 aa  105  5e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  37.65 
 
 
180 aa  105  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.40646e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  34.56 
 
 
399 aa  103  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  35.71 
 
 
982 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  35.54 
 
 
634 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  32.95 
 
 
3060 aa  102  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  39.87 
 
 
166 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  35.66 
 
 
405 aa  102  4e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  37.78 
 
 
450 aa  101  8e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  32.9 
 
 
309 aa  100  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  37.04 
 
 
452 aa  99.8  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  28.31 
 
 
1575 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  32.37 
 
 
558 aa  99  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  30.23 
 
 
500 aa  98.6  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  36.3 
 
 
509 aa  96.7  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  32.61 
 
 
321 aa  96.7  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  33.76 
 
 
451 aa  95.9  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  31.91 
 
 
331 aa  95.9  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  5.89113e-05 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  29.79 
 
 
253 aa  95.5  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  3.86444e-07 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  29.2 
 
 
521 aa  95.1  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  38.4 
 
 
288 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.18 
 
 
1227 aa  92.8  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  38.26 
 
 
228 aa  91.7  6e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  41.79 
 
 
446 aa  91.3  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  29.59 
 
 
275 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  34.69 
 
 
182 aa  88.6  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  28.99 
 
 
647 aa  88.2  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  33.1 
 
 
279 aa  87.8  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  39.33 
 
 
913 aa  87  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  31.47 
 
 
658 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  43.3 
 
 
371 aa  85.5  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  34.13 
 
 
369 aa  80.5  2e-14  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0305  hypothetical protein  41.9 
 
 
496 aa  79.3  4e-14  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0736  hypothetical protein  40.54 
 
 
423 aa  78.2  7e-14  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  34.69 
 
 
414 aa  77.8  1e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  1.16306e-05 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0212  putative lipoprotein  41.86 
 
 
265 aa  75.1  6e-13  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05064  hypothetical protein  40.66 
 
 
158 aa  73.9  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0177  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  73.2  3e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  42.35 
 
 
190 aa  72.4  4e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0134  hypothetical protein  36.52 
 
 
257 aa  72.4  5e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0308  hypothetical protein  36.36 
 
 
181 aa  72  6e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  32.98 
 
 
236 aa  71.6  7e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  45.07 
 
 
95 aa  71.6  7e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0737  hypothetical protein  40 
 
 
413 aa  71.6  8e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.442798  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0557  hypothetical protein  48.53 
 
 
193 aa  68.2  9e-11  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0735  hypothetical protein  36.14 
 
 
415 aa  67  2e-10  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0135  hypothetical protein  42.05 
 
 
324 aa  65.1  7e-10  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  30.2 
 
 
809 aa  63.2  3e-09  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0941  protein of unknown function DUF285 lipoprotein  40.7 
 
 
164 aa  63.2  3e-09  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.885943  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0211  putative lipoprotein  41.38 
 
 
269 aa  57.8  1e-07  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0242  putative lipoprotein  27.74 
 
 
762 aa  53.1  3e-06  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0120138  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05062  hypothetical protein  40.74 
 
 
109 aa  49.3  4e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  30.85 
 
 
2833 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>