More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0046 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  143  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.990539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1710  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  143  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1490  tRNA-Glu  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0046  tRNA-Glu  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2209  tRNA-Glu  100 
 
 
77 bp  143  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.35059  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0182  tRNA-Glu  98.61 
 
 
75 bp  135  2e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1672  tRNA-Glu  97.22 
 
 
75 bp  127  4e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2134  tRNA-Glu  95.83 
 
 
75 bp  119  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00397523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0018  tRNA-Glu  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1585  tRNA-Glu  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.158615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2221  tRNA-Glu  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2176  tRNA-Glu  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0063  tRNA-Glu  88.89 
 
 
75 bp  79.8  8e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0050  tRNA-Glu  88.89 
 
 
75 bp  79.8  8e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0062  tRNA-Glu  88.89 
 
 
75 bp  79.8  8e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.61369e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  94 
 
 
75 bp  75.8  1e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  92.45 
 
 
75 bp  73.8  5e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0077  tRNA-Glu  92.31 
 
 
72 bp  71.9  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0030  tRNA-Glu  92.31 
 
 
72 bp  71.9  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  3.52546e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0001  tRNA-Glu  92.31 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  92.31 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  92.31 
 
 
72 bp  71.9  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  4.03372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  92.31 
 
 
72 bp  71.9  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  92.31 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0605  tRNA-Glu  87.5 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  92.31 
 
 
72 bp  71.9  2e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  92.31 
 
 
72 bp  71.9  2e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0030  tRNA-Glu  92 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.22941e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0045  tRNA-Glu  92 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.02563e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0092  tRNA-Glu  92 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.33389e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  87.67 
 
 
76 bp  65.9  1e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  87.67 
 
 
76 bp  65.9  1e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.662201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0044  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.45211e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0147  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.17529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5653  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.10827e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0014  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  8.39955e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5629  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  9.7671e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0035  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.14108e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5652  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  7.48883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5665  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.88654e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5708  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  9.1391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0118  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.309686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5798  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5832  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0233  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00200909  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0038  tRNA-Glu  91.07 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  4.38841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  89.29 
 
 
153 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.15336e-06  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4775  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.23531e-07  hitchhiker  4.24318e-15 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5051  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.92208e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5146  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.35132e-07  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5013  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  97.22 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  89.29 
 
 
153 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.06064e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  90 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0112  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0151  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.10391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0122  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0116  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00563639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0079  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.10385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0044  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.49136e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0035  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5575  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70531e-28 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1600  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.36382e-11  normal  0.392081 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0454  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.134142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0072  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.46154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0190  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.33026e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0293  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.58541e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0602  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.01894e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0076  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.55984e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0014  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0791017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5248  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.18597e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5343  tRNA-Glu  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.83126e-09  hitchhiker  8.62648e-12 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.47652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0044  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.89195e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.24303e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.29 
 
 
78 bp  63.9  5e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.43078e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0680587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0034  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  89.29 
 
 
78 bp  63.9  5e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.78514e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.29 
 
 
78 bp  63.9  5e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.14932e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  89.29 
 
 
78 bp  63.9  5e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00786644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00381544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  89.29 
 
 
78 bp  63.9  5e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.32296e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0085  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0115  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.97061e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.29 
 
 
78 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.47192e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0092  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0056  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0040  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0031  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0013  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5646  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000268036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5649  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  5.34541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5658  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.40002e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5673  tRNA-Glu  89.29 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  8.36354e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5706  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5711  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.434676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5736  tRNA-Glu  89.29 
 
 
72 bp  63.9  5e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0534212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>