More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0045 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 
252 aa  514  1e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  90.87 
 
 
259 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  90.08 
 
 
259 aa  471  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  90.87 
 
 
259 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  67.06 
 
 
252 aa  361  7e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  65.08 
 
 
252 aa  350  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  63.49 
 
 
252 aa  348  6e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  65.48 
 
 
251 aa  338  5e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  58.27 
 
 
254 aa  311  6e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  47.47 
 
 
257 aa  247  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  46.15 
 
 
336 aa  241  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.81 
 
 
258 aa  240  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  46.46 
 
 
255 aa  239  4e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  46.12 
 
 
262 aa  236  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  47.58 
 
 
251 aa  236  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  46.09 
 
 
259 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  45.1 
 
 
257 aa  234  1e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  43.28 
 
 
268 aa  233  2e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  44.88 
 
 
255 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  45.88 
 
 
255 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  44.88 
 
 
253 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  46.12 
 
 
264 aa  229  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  45.49 
 
 
255 aa  226  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  47.06 
 
 
250 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.3952e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  45.38 
 
 
257 aa  216  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  42.69 
 
 
256 aa  216  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  46.46 
 
 
251 aa  212  4e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.73086e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  43.97 
 
 
248 aa  211  9e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  40.86 
 
 
254 aa  209  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  43.7 
 
 
253 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  44.66 
 
 
249 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  43.31 
 
 
257 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.73 
 
 
237 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  44.14 
 
 
249 aa  205  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  43.58 
 
 
250 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  43.65 
 
 
253 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.30541e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  43.53 
 
 
249 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 
250 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  40.77 
 
 
255 aa  201  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  41.18 
 
 
254 aa  201  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  42.97 
 
 
253 aa  201  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  41.31 
 
 
252 aa  201  1e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.56655e-05 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  43.14 
 
 
251 aa  201  1e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  41.96 
 
 
252 aa  201  1e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  42.53 
 
 
250 aa  201  1e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  38.91 
 
 
254 aa  200  2e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  42.75 
 
 
252 aa  200  2e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  41.38 
 
 
252 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 
252 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 
252 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 
252 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1797e-11 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 
252 aa  199  4e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  42.41 
 
 
255 aa  197  1e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  40.86 
 
 
253 aa  197  2e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  40.55 
 
 
254 aa  195  5e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 
254 aa  195  7e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  42.69 
 
 
251 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  38.08 
 
 
261 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  40.39 
 
 
252 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  42.8 
 
 
247 aa  192  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  39.84 
 
 
257 aa  191  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.3 
 
 
259 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  36.11 
 
 
301 aa  189  3e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  39.15 
 
 
260 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  37.31 
 
 
254 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  37.65 
 
 
254 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  6.0728e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  39.45 
 
 
256 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.85 
 
 
257 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  41.18 
 
 
260 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  41.18 
 
 
260 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  39.61 
 
 
257 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  35.8 
 
 
260 aa  183  2e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  38.34 
 
 
258 aa  182  5e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  35.27 
 
 
285 aa  182  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  37.89 
 
 
260 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  39.06 
 
 
259 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  37.25 
 
 
257 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  37.25 
 
 
257 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  37.35 
 
 
256 aa  179  3e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  37.35 
 
 
256 aa  179  3e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  37.35 
 
 
256 aa  179  3e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.22 
 
 
258 aa  179  3e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  37.35 
 
 
256 aa  179  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  37.35 
 
 
256 aa  179  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  37.35 
 
 
256 aa  179  3e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  37.35 
 
 
256 aa  179  3e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  36.86 
 
 
256 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  37.65 
 
 
257 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  37.65 
 
 
257 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.65 
 
 
257 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  38.61 
 
 
261 aa  178  6e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  38.61 
 
 
261 aa  178  6e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  37.5 
 
 
259 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  37.25 
 
 
257 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  37.35 
 
 
259 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 
270 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 
256 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.11 
 
 
259 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  37.4 
 
 
259 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  37.26 
 
 
261 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>