211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0044 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0044  conserved hypothetical protein, putative sulfatase  100 
 
 
510 aa  1041    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0283  sulfatase, putative  51.84 
 
 
512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1725  sulfatase, putative  51.54 
 
 
512 aa  514  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0306  sulfatase, putative  51.56 
 
 
512 aa  501  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1723  type III effector HopAH2-2  43.91 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0088  type III effector HopAH2-2  44.9 
 
 
520 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000528702  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2128  sulfatase  38.33 
 
 
549 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2037  sulfatase  39.88 
 
 
518 aa  354  2e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3835  putative cell division protein  38.25 
 
 
548 aa  350  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.830183  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4015  putative cell division protein  38.78 
 
 
548 aa  349  7e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  37.57 
 
 
544 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  37.88 
 
 
549 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  38.1 
 
 
539 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2204  putative cell division protein  36.83 
 
 
545 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00407882  hitchhiker  0.00021657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4548  putative cell division protein  37 
 
 
547 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4555  putative cell division protein  37 
 
 
547 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4639  putative cell division protein  37 
 
 
547 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.500642  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4639  putative cell division protein  37 
 
 
547 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739605  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1978  sulfatase  39.39 
 
 
545 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  36.31 
 
 
549 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1724  hypothetical protein  38.09 
 
 
552 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0657943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  36.88 
 
 
543 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  35.13 
 
 
565 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  36.84 
 
 
558 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  35.13 
 
 
565 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  35.13 
 
 
565 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  35.13 
 
 
565 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0311  putative cell division protein  37.58 
 
 
547 aa  323  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00469316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  35.29 
 
 
547 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  36.77 
 
 
545 aa  323  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0677  sulfatase  37.08 
 
 
568 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3156  hypothetical protein  37.6 
 
 
552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4668  putative cell division protein  36.26 
 
 
557 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4354  putative cell division protein  36.26 
 
 
557 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03985  predicted metal dependent hydrolase  36.26 
 
 
547 aa  320  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03946  hypothetical protein  36.26 
 
 
547 aa  320  5e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3913  putative cell division protein  36.07 
 
 
547 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482913  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3878  sulfatase  36.07 
 
 
557 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5627  putative cell division protein  36.07 
 
 
547 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  35.33 
 
 
545 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4579  putative cell division protein  36.07 
 
 
547 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  35.63 
 
 
545 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  35.44 
 
 
545 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1048  sulfatase  39.06 
 
 
580 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2041  hypothetical protein  37.64 
 
 
542 aa  312  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1764  putative cell division protein  33.95 
 
 
545 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.95541e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2563  putative cell division protein  33.95 
 
 
545 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000004423  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1873  putative cell division protein  33.95 
 
 
545 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000430233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1454  sulfatase  34.99 
 
 
542 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  35.31 
 
 
572 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3435  sulfatase  37.5 
 
 
560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2048  hypothetical protein  35.7 
 
 
541 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  35.7 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  37.06 
 
 
544 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2228  sulfatase  36.33 
 
 
541 aa  302  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2103  sulfatase  36.14 
 
 
541 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1871  sulfatase  36.14 
 
 
541 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.754116  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39020  hypothetical protein  33.84 
 
 
567 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446171  normal  0.409491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2097  sulfatase  35.62 
 
 
541 aa  299  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000583  hypothetical protein  34.45 
 
 
551 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1810  hypothetical protein  37.04 
 
 
551 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0352  membrane associated sultatease  35.78 
 
 
551 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6033  sulfatase  33.64 
 
 
580 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.218752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0341  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  39.91 
 
 
532 aa  296  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3478  sulfatase  35.96 
 
 
541 aa  295  9e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2254  hypothetical protein  35.21 
 
 
541 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000771345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2371  hypothetical protein  35.39 
 
 
541 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00897064  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2091  protein of unknown function DUF1705  35.39 
 
 
541 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0178711  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1167  hypothetical protein  34.13 
 
 
557 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2103  hypothetical protein  35.21 
 
 
541 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21210  hypothetical protein  37.21 
 
 
551 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1858  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  33.88 
 
 
554 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  34.73 
 
 
544 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  34.73 
 
 
544 aa  290  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1758  hypothetical protein  32.95 
 
 
538 aa  289  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.534399  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2326  sulfatase  33.39 
 
 
547 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.995391  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0141  hypothetical protein  36.7 
 
 
502 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05289  lipid A phosphoethanolamine transferase  36.33 
 
 
550 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2717  putative sulfatase  35.32 
 
 
555 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3264  putative sulfatase  34.57 
 
 
556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225612  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3642  sulfatase  34.4 
 
 
560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418054  normal  0.084742 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1161  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  33.73 
 
 
576 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2500  hypothetical protein  33.65 
 
 
573 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.549124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  33.97 
 
 
575 aa  280  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1955  sulfatase  32.58 
 
 
589 aa  279  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.822176  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  33.67 
 
 
544 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2705  sulfatase  31.5 
 
 
557 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1718  sulfatase  34.34 
 
 
588 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1756  sulfatase  32.2 
 
 
550 aa  277  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1245  sulfatase  33.87 
 
 
572 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.761831 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1854  inner membrane protein  33.47 
 
 
552 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.458981  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1783  sulfatase  33.26 
 
 
552 aa  272  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.349972  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  34.91 
 
 
535 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04472  inner membrane protein  32.74 
 
 
532 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3812  sulfatase  33.4 
 
 
549 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0194754  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3085  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  33.4 
 
 
549 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1931  sulfatase  33.47 
 
 
582 aa  266  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.514301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1142  sulfatase  33.68 
 
 
583 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285373  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2193  sulfatase  29.81 
 
 
542 aa  259  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444618  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3130  sulfatase  32.77 
 
 
564 aa  259  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.013055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>