170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0041 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0041  dihydroorotase  100 
 
 
330 aa  678  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0309  dihydroorotase  92.1 
 
 
331 aa  627  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311642  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1722  dihydroorotase  80.48 
 
 
335 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.798231  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0286  dihydroorotase  78.98 
 
 
335 aa  547  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0190  dihydroorotase  54.85 
 
 
330 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.934033 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0624  dihydroorotase  57.93 
 
 
335 aa  382  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.841331  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2027  dihydroorotase  51.5 
 
 
333 aa  365  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1848  dihydroorotase  54.1 
 
 
367 aa  364  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.100177  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1778  dihydroorotase  51.52 
 
 
327 aa  358  7e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2557  dihydroorotase  54.1 
 
 
339 aa  358  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  41.11 
 
 
348 aa  240  3e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  41.57 
 
 
343 aa  239  3e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.56431e-14 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  41.11 
 
 
348 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  40.52 
 
 
347 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  39.65 
 
 
348 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  40.75 
 
 
354 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  38.53 
 
 
340 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  40.82 
 
 
348 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  39.47 
 
 
355 aa  232  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  40.29 
 
 
364 aa  232  8e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  4.32842e-06  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  38.19 
 
 
344 aa  231  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  38.95 
 
 
346 aa  231  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  38.9 
 
 
352 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  40.52 
 
 
348 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  40.52 
 
 
348 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  40.35 
 
 
353 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  40.52 
 
 
348 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  40.52 
 
 
348 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  40 
 
 
354 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  39.77 
 
 
354 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  38.9 
 
 
352 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  40.52 
 
 
348 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  40.23 
 
 
348 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  40.52 
 
 
348 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  40.52 
 
 
348 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  40.52 
 
 
348 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  39.36 
 
 
347 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  39.07 
 
 
344 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  40.35 
 
 
343 aa  230  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  37.03 
 
 
346 aa  230  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  40.23 
 
 
348 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  39.88 
 
 
354 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  40.23 
 
 
348 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  38.48 
 
 
344 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55652e-06 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  43.31 
 
 
346 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  39.65 
 
 
347 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  38.62 
 
 
378 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  8.04434e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  38.62 
 
 
352 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  38.62 
 
 
352 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  38.62 
 
 
352 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  38.62 
 
 
352 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  38.62 
 
 
352 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  40.23 
 
 
348 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  40.23 
 
 
348 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  41.23 
 
 
359 aa  228  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  39.6 
 
 
364 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  39.6 
 
 
364 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  39.6 
 
 
354 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  40.23 
 
 
348 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  38.19 
 
 
345 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  40.23 
 
 
348 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  38.19 
 
 
345 aa  226  5e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  39.77 
 
 
353 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  2.12736e-06 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  39.36 
 
 
345 aa  225  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  38.01 
 
 
343 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4467  dihydroorotase  38.51 
 
 
347 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  37.21 
 
 
346 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  38.78 
 
 
344 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  40.06 
 
 
342 aa  222  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  39.36 
 
 
349 aa  222  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  40.52 
 
 
345 aa  221  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0130  dihydroorotase  40.78 
 
 
348 aa  221  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  40.63 
 
 
346 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  38.3 
 
 
347 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  38.08 
 
 
348 aa  219  4e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  39.65 
 
 
345 aa  219  4e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  38.95 
 
 
344 aa  219  4e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  38.44 
 
 
382 aa  219  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  38.44 
 
 
382 aa  219  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  38.66 
 
 
344 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  37.72 
 
 
348 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  37.79 
 
 
348 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  40.41 
 
 
344 aa  219  8e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  38.6 
 
 
347 aa  218  8e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  38.78 
 
 
343 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  38.48 
 
 
351 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  37.79 
 
 
344 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  37.72 
 
 
351 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  39.13 
 
 
366 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  38.78 
 
 
347 aa  216  3e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  38.78 
 
 
347 aa  216  3e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  36.73 
 
 
347 aa  216  3e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  38.78 
 
 
347 aa  216  3e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  37.5 
 
 
348 aa  216  3e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  37.9 
 
 
348 aa  216  3e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  37.9 
 
 
345 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  38.89 
 
 
347 aa  216  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  39.47 
 
 
342 aa  216  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  38.19 
 
 
344 aa  216  6e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  39.02 
 
 
345 aa  215  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>