More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0038 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0038  cation ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  64.92 
 
 
284 aa  343  1e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  64.52 
 
 
284 aa  342  3e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  65.32 
 
 
284 aa  342  3e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 
281 aa  293  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
251 aa  279  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  58.7 
 
 
260 aa  268  8e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  52.61 
 
 
273 aa  258  5e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
253 aa  236  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  44.34 
 
 
258 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 
249 aa  184  1e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  43.39 
 
 
258 aa  182  4e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  43.39 
 
 
258 aa  182  4e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
230 aa  174  8e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  41.47 
 
 
257 aa  171  8e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  43.06 
 
 
257 aa  171  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 
243 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  36.63 
 
 
294 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  40.74 
 
 
250 aa  165  7e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  38.14 
 
 
262 aa  162  5e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
260 aa  162  5e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
256 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.991e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  43.18 
 
 
256 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
256 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
256 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
256 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
256 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
256 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
256 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  9.02148e-06 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
256 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  43.32 
 
 
257 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  40.62 
 
 
255 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.18 
 
 
256 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
245 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  42.34 
 
 
252 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  34.25 
 
 
311 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  41.36 
 
 
262 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  40.76 
 
 
273 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
250 aa  156  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  5.27176e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  41.1 
 
 
254 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  37.14 
 
 
251 aa  155  5e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  39.09 
 
 
246 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  40.36 
 
 
247 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  40.76 
 
 
249 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
246 aa  152  3e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  42.8 
 
 
261 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  42.8 
 
 
261 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  38.25 
 
 
258 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  39.35 
 
 
251 aa  152  6e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
254 aa  152  6e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  35.08 
 
 
287 aa  151  9e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1687  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
260 aa  151  9e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
254 aa  150  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  34.24 
 
 
278 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  6.67877e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  39.53 
 
 
254 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 
243 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  35.14 
 
 
255 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  39.71 
 
 
250 aa  149  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  39.29 
 
 
263 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  39.37 
 
 
236 aa  149  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  8.34751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
249 aa  148  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.89 
 
 
254 aa  148  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  39.63 
 
 
259 aa  148  1e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  8.37637e-09  hitchhiker  4.50172e-06 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  38.6 
 
 
251 aa  147  1e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.67 
 
 
258 aa  147  1e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
261 aa  146  2e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  36.19 
 
 
262 aa  147  2e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.5 
 
 
259 aa  147  2e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  38.86 
 
 
265 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  38.97 
 
 
259 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
255 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  37.84 
 
 
280 aa  145  8e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  43.65 
 
 
257 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  34.96 
 
 
246 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 
249 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  37.62 
 
 
249 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  40.78 
 
 
249 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.19302e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
536 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  38.83 
 
 
262 aa  144  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.65117e-06 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 
249 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.73887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  40.64 
 
 
250 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  37.38 
 
 
263 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.07 
 
 
258 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
249 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
249 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  39.15 
 
 
236 aa  142  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  38.97 
 
 
260 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  37.33 
 
 
266 aa  141  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  36.19 
 
 
252 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  39.2 
 
 
251 aa  141  1e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.61 
 
 
251 aa  141  1e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 
245 aa  141  1e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.1 
 
 
226 aa  141  1e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  38.57 
 
 
264 aa  141  1e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
259 aa  141  1e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.89 
 
 
418 aa  141  1e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  32.26 
 
 
255 aa  140  1e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  35.93 
 
 
248 aa  140  1e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  38.43 
 
 
268 aa  141  1e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
262 aa  140  2e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>