More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0027 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0027  undecaprenol kinase, putative  100 
 
 
268 aa  521  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  72.69 
 
 
267 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  73.44 
 
 
267 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  72.69 
 
 
267 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  57.48 
 
 
258 aa  282  5e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  51.6 
 
 
258 aa  256  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  48.41 
 
 
255 aa  243  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  49.19 
 
 
252 aa  242  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  9.43331e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  53.88 
 
 
252 aa  242  5e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1667  undecaprenol kinase  47.98 
 
 
254 aa  234  1e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  44.71 
 
 
255 aa  233  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  46.75 
 
 
254 aa  225  5e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  47.41 
 
 
256 aa  222  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  44 
 
 
254 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  43.68 
 
 
255 aa  211  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  45.59 
 
 
273 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  42.25 
 
 
258 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  44.03 
 
 
276 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.56 
 
 
273 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  48.31 
 
 
266 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.91 
 
 
274 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.42 
 
 
277 aa  198  8e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  197  1e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
270 aa  197  1e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  197  1e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  197  1e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.75 
 
 
276 aa  197  1e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  44.79 
 
 
273 aa  197  1e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  197  1e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  197  1e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.74172e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  197  1e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  44.79 
 
 
273 aa  197  1e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.14 
 
 
273 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.98 
 
 
272 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.14 
 
 
273 aa  196  4e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.14 
 
 
273 aa  196  4e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.14 
 
 
273 aa  196  4e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.14 
 
 
273 aa  196  4e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.57 
 
 
272 aa  194  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.98 
 
 
276 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1502  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.98 
 
 
263 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1542  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.98 
 
 
263 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0270551  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.28 
 
 
272 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.91232e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.82 
 
 
303 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.28 
 
 
272 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.28 
 
 
272 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  43.28 
 
 
276 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.96 
 
 
275 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.61 
 
 
272 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.54 
 
 
274 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  42.04 
 
 
263 aa  191  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1110  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.36 
 
 
263 aa  191  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.8 
 
 
274 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1296  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.23 
 
 
263 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00356905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1403  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.23 
 
 
263 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1270  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.23 
 
 
263 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.033406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.23 
 
 
263 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.87 
 
 
276 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0882  undecaprenol kinase  40 
 
 
259 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1436  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.64 
 
 
263 aa  189  3e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.648301  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
277 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.8 
 
 
274 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.44 
 
 
274 aa  188  6e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  2.0273e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.55 
 
 
278 aa  188  6e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.23 
 
 
263 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.07 
 
 
276 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.53 
 
 
267 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  42.86 
 
 
269 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.23 
 
 
274 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3908  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.26 
 
 
263 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1268  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.26 
 
 
263 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.88 
 
 
277 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.88 
 
 
277 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.48 
 
 
277 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0395  undecaprenol kinase  43.15 
 
 
256 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0363405  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.7 
 
 
276 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.44 
 
 
274 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.61 
 
 
266 aa  185  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.89 
 
 
277 aa  185  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.97 
 
 
276 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  42.42 
 
 
266 aa  185  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.31 
 
 
269 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.03456e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.33 
 
 
277 aa  184  1e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.45 
 
 
293 aa  184  1e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  40.52 
 
 
274 aa  183  2e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0795  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
273 aa  183  2e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.81 
 
 
293 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.47 
 
 
268 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4087  undecaprenol kinase  48.34 
 
 
270 aa  182  4e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0278753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0312  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 
265 aa  182  5e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.53 
 
 
274 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  41.38 
 
 
293 aa  181  9e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2758  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.75 
 
 
273 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.23716e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0251  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.15 
 
 
265 aa  180  3e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.23 
 
 
270 aa  180  3e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  37.59 
 
 
286 aa  180  3e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0254  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.15 
 
 
265 aa  180  3e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.11 
 
 
272 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 
265 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.6 
 
 
273 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>