More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0015 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  100 
 
 
355 aa  716  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  87.32 
 
 
355 aa  618  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  87.61 
 
 
355 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  87.04 
 
 
355 aa  614  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  80.29 
 
 
355 aa  590  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  79.44 
 
 
355 aa  585  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1719  peptide chain release factor 1  78.03 
 
 
355 aa  555  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  74.08 
 
 
355 aa  550  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  74.37 
 
 
355 aa  531  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  67.61 
 
 
355 aa  500  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  58.47 
 
 
360 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.28118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  58.47 
 
 
360 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  7.99175e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 
355 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 
356 aa  416  1e-115  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  57.43 
 
 
355 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  56.2 
 
 
360 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  59.88 
 
 
359 aa  407  1e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  55.91 
 
 
360 aa  405  1e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 
360 aa  404  1e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  55.91 
 
 
360 aa  405  1e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  55.91 
 
 
360 aa  405  1e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  55.33 
 
 
360 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 
363 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  59.59 
 
 
359 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 
355 aa  400  1e-110  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  55.33 
 
 
360 aa  400  1e-110  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 
360 aa  400  1e-110  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  55.04 
 
 
360 aa  399  1e-110  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 
355 aa  400  1e-110  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  55.04 
 
 
360 aa  399  1e-110  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  55.04 
 
 
360 aa  399  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  55.33 
 
 
360 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 
360 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  54 
 
 
360 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  55.04 
 
 
360 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 
355 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  54 
 
 
360 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  54 
 
 
360 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  54 
 
 
360 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 
361 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  53.01 
 
 
357 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  56.03 
 
 
360 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  55.33 
 
 
360 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  57.02 
 
 
363 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 
360 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  56.34 
 
 
357 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.16881e-11  hitchhiker  3.05481e-10 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  56.81 
 
 
355 aa  391  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.63816e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 
360 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  57.02 
 
 
363 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 
357 aa  391  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 
360 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 
361 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 
360 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 
356 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  9.63425e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  54.76 
 
 
361 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 
363 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 
361 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.99484e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 
354 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 
360 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 
363 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 
363 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 
363 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
360 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 
360 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 
356 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.57905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  53.31 
 
 
360 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 
360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 
363 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  4.10243e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 
363 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 
356 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 
363 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  54.73 
 
 
361 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  56.32 
 
 
360 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 
363 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  55.01 
 
 
361 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 
363 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  8.15596e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 
355 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.06535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 
360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  55.01 
 
 
360 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  55.59 
 
 
361 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
360 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 
361 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  55.04 
 
 
360 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  54.15 
 
 
362 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  54.73 
 
 
362 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  54.15 
 
 
362 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 
363 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 
353 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
360 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 
360 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 
370 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 
361 aa  378  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 
370 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  55.74 
 
 
358 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  53.67 
 
 
355 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 
372 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
355 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 
370 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 
358 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 
356 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>