124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0014 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 
226 aa  80.5  2e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5666  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 
155 aa  74.7  7e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326026  hitchhiker  0.0069947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 
148 aa  74.7  8e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  39.02 
 
 
148 aa  74.3  1e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03391  Hpa2  44.09 
 
 
108 aa  73.9  1e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 
149 aa  73.6  2e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 
159 aa  73.2  2e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  35.65 
 
 
146 aa  73.6  2e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  36.59 
 
 
147 aa  73.2  2e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  36.79 
 
 
175 aa  72.8  3e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 
168 aa  72.4  3e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  35.83 
 
 
148 aa  72.4  4e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 
168 aa  72  5e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  35.83 
 
 
161 aa  71.6  6e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5883  lytic transglycosylase, catalytic  34.82 
 
 
155 aa  71.6  6e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.161206  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
164 aa  70.5  1e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  37.29 
 
 
149 aa  70.9  1e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
164 aa  70.5  1e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  35 
 
 
149 aa  70.9  1e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  35.54 
 
 
164 aa  69.7  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  34.43 
 
 
152 aa  69.3  3e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  34.69 
 
 
161 aa  69.3  4e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  34.69 
 
 
161 aa  69.3  4e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  34.69 
 
 
161 aa  68.9  4e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  32.82 
 
 
155 aa  68.6  5e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  40.37 
 
 
152 aa  67.8  9e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  40.37 
 
 
152 aa  67.8  9e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  40.37 
 
 
152 aa  67.8  9e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  43.75 
 
 
216 aa  67.4  1e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  34.78 
 
 
170 aa  67.4  1e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.93 
 
 
168 aa  67.8  1e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 
153 aa  66.6  2e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 
166 aa  66.2  2e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  1.17899e-05 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  31.37 
 
 
180 aa  66.6  2e-10  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  40.19 
 
 
152 aa  66.2  3e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  36.46 
 
 
160 aa  65.5  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  33.63 
 
 
179 aa  65.9  4e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  36.46 
 
 
160 aa  65.5  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16628e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  36.46 
 
 
160 aa  65.5  5e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  36.46 
 
 
160 aa  65.5  5e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  36.46 
 
 
160 aa  65.5  5e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  32.82 
 
 
178 aa  65.1  6e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3138  Lytic transglycosylase catalytic  31.9 
 
 
157 aa  63.9  1e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.82617  normal  0.443685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2772  Lytic transglycosylase catalytic  31.9 
 
 
157 aa  63.9  1e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0111  lytic transglycosylase PilT  32.17 
 
 
186 aa  63.9  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 
161 aa  63.9  1e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 
145 aa  62.8  3e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  38.3 
 
 
187 aa  63.2  3e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  30.71 
 
 
170 aa  62.8  3e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  37.63 
 
 
161 aa  62.4  4e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  37.23 
 
 
187 aa  62  5e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  37.23 
 
 
187 aa  62  5e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  37.23 
 
 
187 aa  62  5e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  37.23 
 
 
187 aa  62  5e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  33.96 
 
 
182 aa  62  5e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  37.23 
 
 
187 aa  62  6e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_23  transglycosylase PilT  32.69 
 
 
145 aa  61.6  7e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.846222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  33.02 
 
 
183 aa  61.2  9e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  28.47 
 
 
180 aa  60.5  1e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  38.3 
 
 
182 aa  60.8  1e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05356  putative lipoprotein  33.94 
 
 
232 aa  60.1  2e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.592846  normal  0.453874 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  27.93 
 
 
140 aa  59.7  3e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  36.17 
 
 
145 aa  59.3  3e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6789  lytic transglycosylase, catalytic  31.63 
 
 
165 aa  59.3  3e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 
408 aa  58.2  7e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 
408 aa  58.2  7e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 
213 aa  57.8  1e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  26.42 
 
 
190 aa  57.4  1e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  34.58 
 
 
599 aa  56.6  2e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 
438 aa  56.6  2e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0632  Lytic transglycosylase catalytic  31.82 
 
 
175 aa  56.6  2e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  31.25 
 
 
239 aa  55.8  3e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  28.76 
 
 
197 aa  56.2  3e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 
183 aa  56.2  3e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4125  lytic transglycosylase PilT  33.33 
 
 
167 aa  55.8  3e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.76698e-05 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  33.04 
 
 
407 aa  56.2  3e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 
404 aa  55.8  4e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 
183 aa  55.5  5e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  32.14 
 
 
404 aa  54.3  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5437  lytic transglycosylase, catalytic  26.77 
 
 
179 aa  53.9  1e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43825  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6234  lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 
151 aa  54.3  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  30.36 
 
 
239 aa  54.3  1e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2846e-11 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  27.08 
 
 
222 aa  53.5  2e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  31.88 
 
 
182 aa  53.1  2e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 
187 aa  53.1  2e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  27.08 
 
 
179 aa  53.5  2e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  34.74 
 
 
210 aa  53.1  3e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 
248 aa  53.1  3e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  27.34 
 
 
164 aa  52.8  3e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  27.08 
 
 
181 aa  52.4  4e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0860  lytic transglycosylase catalytic  34.69 
 
 
124 aa  52.4  4e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720569  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2236  conjugal transfer protein TrbN  31.43 
 
 
199 aa  52.4  4e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  28.47 
 
 
174 aa  51.6  6e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5233  lytic transglycosylase, catalytic  31.2 
 
 
203 aa  51.6  6e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00145184  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 
145 aa  52  6e-06  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1434  conjugal transfer protein TrbN  31.43 
 
 
201 aa  51.2  9e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0043  lytic transglycosylase  35.35 
 
 
215 aa  50.4  1e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4262  conjugal transfer protein TrbN  31.25 
 
 
211 aa  50.8  1e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457278 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6514  conjugal transfer protein TrbN  31.25 
 
 
211 aa  50.4  1e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>