189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0010 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  100 
 
 
69 aa  132  1e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  89.86 
 
 
69 aa  121  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  89.86 
 
 
69 aa  119  1e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  86.96 
 
 
69 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1028  hypothetical protein  63.77 
 
 
102 aa  92  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  9.70664e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  65.15 
 
 
70 aa  81.6  3e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.72 
 
 
112 aa  81.6  4e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  56.72 
 
 
112 aa  81.3  5e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  56.72 
 
 
112 aa  81.3  5e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  62.69 
 
 
69 aa  80.5  8e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.21 
 
 
110 aa  80.1  9e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  57.58 
 
 
112 aa  80.1  1e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  57.58 
 
 
72 aa  79  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  59.09 
 
 
73 aa  79  2e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  59.09 
 
 
72 aa  79  2e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.72 
 
 
113 aa  78.6  2e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  59.09 
 
 
111 aa  78.2  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  59.09 
 
 
111 aa  78.2  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  59.09 
 
 
111 aa  78.2  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  59.09 
 
 
111 aa  78.2  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  59.09 
 
 
72 aa  78.2  3e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  59.09 
 
 
111 aa  78.2  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  56.72 
 
 
122 aa  78.6  3e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  62.69 
 
 
71 aa  78.2  3e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  60.61 
 
 
73 aa  78.2  4e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  55.38 
 
 
109 aa  77.8  4e-14  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17474e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.58 
 
 
111 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  57.58 
 
 
111 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  57.58 
 
 
111 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.58 
 
 
137 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  57.58 
 
 
111 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  57.58 
 
 
111 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.58 
 
 
137 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  57.58 
 
 
111 aa  77.8  5e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  57.58 
 
 
111 aa  77.8  5e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1818  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.55 
 
 
113 aa  77.4  6e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942108  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2159  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.55 
 
 
113 aa  77.4  6e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  56.06 
 
 
109 aa  77.4  6e-14  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  7.73889e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.55 
 
 
112 aa  77  7e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  53.03 
 
 
112 aa  77  8e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.52 
 
 
112 aa  77  8e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  56.06 
 
 
72 aa  77  8e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.58 
 
 
113 aa  77  8e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  59.09 
 
 
111 aa  76.6  1e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  59.09 
 
 
111 aa  76.3  1e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.06 
 
 
113 aa  76.3  1e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  53.03 
 
 
114 aa  75.5  2e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.75 
 
 
113 aa  75.5  2e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  59.09 
 
 
73 aa  75.5  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0433  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.85 
 
 
112 aa  75.9  2e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.58 
 
 
113 aa  75.5  2e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.58 
 
 
113 aa  75.5  2e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4283  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
113 aa  75.1  3e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  59.09 
 
 
70 aa  74.7  4e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.06 
 
 
113 aa  74.7  4e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.46 
 
 
113 aa  74.7  4e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.46 
 
 
113 aa  74.7  4e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.52 
 
 
112 aa  74.7  4e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  58.46 
 
 
113 aa  74.7  4e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
112 aa  74.7  4e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.55 
 
 
112 aa  74.3  5e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.76 
 
 
130 aa  74.3  5e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.55 
 
 
112 aa  74.3  5e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
113 aa  73.6  9e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
113 aa  73.6  1e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
113 aa  72.8  1e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.52 
 
 
112 aa  73.2  1e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
113 aa  73.6  1e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
112 aa  72.8  1e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
120 aa  73.2  1e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  53.03 
 
 
120 aa  73.2  1e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
112 aa  72.8  1e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  8.32125e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
113 aa  73.6  1e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
113 aa  73.6  1e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
113 aa  73.6  1e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.21 
 
 
111 aa  73.2  1e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  55.56 
 
 
69 aa  72.8  1e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  50.75 
 
 
113 aa  73.2  1e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
113 aa  73.2  1e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  53.03 
 
 
120 aa  73.2  1e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.24 
 
 
113 aa  72  2e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  71.6  3e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  54.55 
 
 
131 aa  71.6  3e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.55 
 
 
79 aa  72  3e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.75 
 
 
112 aa  71.6  3e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  53.03 
 
 
101 aa  71.6  3e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  50.75 
 
 
114 aa  71.6  4e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.03 
 
 
113 aa  71.2  5e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
112 aa  70.9  6e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  48.48 
 
 
113 aa  70.9  6e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  46.27 
 
 
113 aa  70.5  7e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.22 
 
 
111 aa  70.1  9e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  47.76 
 
 
124 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.25 
 
 
112 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.25 
 
 
113 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.25 
 
 
113 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  51.52 
 
 
99 aa  69.7  1e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.25 
 
 
113 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
134 aa  69.7  1e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  52.31 
 
 
101 aa  69.7  1e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>