15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0008 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  231  4e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  74.07 
 
 
113 aa  163  7e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  74.07 
 
 
113 aa  163  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  43.82 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  40.91 
 
 
131 aa  79.3  1e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  38.64 
 
 
135 aa  69.7  1e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  40.57 
 
 
127 aa  69.3  2e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  35.85 
 
 
127 aa  65.5  3e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  35.85 
 
 
127 aa  65.1  3e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  34.91 
 
 
127 aa  63.9  6e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.51615e-07 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  39.53 
 
 
183 aa  62.4  2e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  34.78 
 
 
129 aa  61.2  4e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  35.24 
 
 
126 aa  59.3  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  7.59972e-06 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  35.85 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4082  hypothetical protein  36.54 
 
 
121 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>