136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0006 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0006  7-cyano-7-deazaguanine reductase  100 
 
 
127 aa  263  7e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1892  7-cyano-7-deazaguanine reductase  93.7 
 
 
127 aa  253  7e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0020  7-cyano-7-deazaguanine reductase  92.91 
 
 
127 aa  251  2e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2097  7-cyano-7-deazaguanine reductase  92.86 
 
 
126 aa  250  4e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1849  response regulator  77.34 
 
 
198 aa  205  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0005  7-cyano-7-deazaguanine reductase  72.58 
 
 
146 aa  194  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  74.4 
 
 
131 aa  192  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0006  NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase (NADPH-dependent nitrile oxidoreductase)  66.4 
 
 
184 aa  182  1e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0004  7-cyano-7-deazaguanine reductase  68.85 
 
 
125 aa  179  9e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1181  7-cyano-7-deazaguanine reductase  55.74 
 
 
128 aa  145  2e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0230  7-cyano-7-deazaguanine reductase  56.3 
 
 
142 aa  134  3e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3009  7-cyano-7-deazaguanine reductase  56.2 
 
 
142 aa  129  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3110  7-cyano-7-deazaguanine reductase  56.2 
 
 
142 aa  129  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0840  7-cyano-7-deazaguanine reductase  51.22 
 
 
123 aa  128  2e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000632254  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3670  7-cyano-7-deazaguanine reductase  53.72 
 
 
140 aa  127  5e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3061  7-cyano-7-deazaguanine reductase  53.78 
 
 
138 aa  126  9e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2098  7-cyano-7-deazaguanine reductase  53.78 
 
 
141 aa  124  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.819295  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4416  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.07 
 
 
136 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0991  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.59 
 
 
140 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.279771  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18601  7-cyano-7-deazaguanine reductase  52.59 
 
 
128 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.780472  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15801  GTP cyclohydrolase I-like protein  50.85 
 
 
139 aa  113  1e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0471  7-cyano-7-deazaguanine reductase  49.57 
 
 
137 aa  112  2e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2205  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.83 
 
 
129 aa  109  1e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.709249  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04701  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.83 
 
 
135 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4094  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.44 
 
 
159 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0823325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4219  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.44 
 
 
122 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4244  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.44 
 
 
122 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0237434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0331  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.12 
 
 
122 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0279234  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0644  GTP cyclohydrolase I  43.81 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.486051  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0160  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.38 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0678  GTP cyclohydrolase I  40.95 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2027  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.65 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16401  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.06 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1696  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.55 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.510769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1067  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.95 
 
 
165 aa  97.1  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16511  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.22 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1554  7-cyano-7-deazaguanine reductase  47.06 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1235  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.04 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1500  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.04 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.20055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1461  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.04 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2441  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.09 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00534909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1260  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.04 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1397  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.04 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1433  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.04 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.99367e-14 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1259  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.04 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3946  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.04 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105864  normal  0.027298 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1362  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.04 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0220025  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1881  GTP cyclohydrolase I  43.12 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16631  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.22 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.25957  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1233  7-cyano-7-deazaguanine reductase  43.12 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0872  7-cyano-7-deazaguanine reductase  46.55 
 
 
163 aa  94  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.697802  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.46 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.35 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1347  7-cyano-7-deazaguanine reductase  45.19 
 
 
188 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1832  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.06 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.220331  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3304  GTP cyclohydrolase I  44.09 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0577571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1227  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.18 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0657865  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1400  7-cyano-7-deazaguanine reductase  42.86 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1773  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.44 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0769  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.86 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0751  7-cyano-7-deazaguanine reductase  48.86 
 
 
166 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172139  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1140  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.2 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.972823  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0394  7-cyano-7-deazaguanine reductase  44.86 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12670  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.74 
 
 
180 aa  87.4  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.883565  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22450  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.64 
 
 
166 aa  87  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.914422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2808  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.86 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146173  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3074  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.78 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2906  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.46 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.61276  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2063  7-cyano-7-deazaguanine reductase  41.76 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2783  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.46 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3011  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.46 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0899  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.826218  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0752  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.384081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3421  GTP cyclohydrolase I  39.36 
 
 
128 aa  84  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0847539  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3262  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40.4 
 
 
154 aa  84  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1578  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.36 
 
 
140 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.921264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2025  7-cyano-7-deazaguanine reductase  40 
 
 
165 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0305179  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1341  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.36 
 
 
154 aa  82  2e-15  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2482  7-cyano-7-deazaguanine reductase  36.84 
 
 
158 aa  82.4  2e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.245028  normal  0.291037 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0653  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.47 
 
 
167 aa  81.3  4e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3151  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.64 
 
 
154 aa  81.3  4e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0333619  normal  0.222915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2779  7-cyano-7-deazaguanine reductase  34.95 
 
 
158 aa  81.3  4e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4472  7-cyano-7-deazaguanine reductase  38.95 
 
 
158 aa  81.3  4e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51352  normal  0.783738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2817  7-cyano-7-deazaguanine reductase  34.95 
 
 
158 aa  81.3  4e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153581  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1311  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.08 
 
 
159 aa  81.3  4e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1060  7-cyano-7-deazaguanine reductase  35.29 
 
 
153 aa  80.9  5e-15  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.356271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0983  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.36 
 
 
162 aa  80.5  7e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1809  GTP cyclohydrolase I-related enzyme  35.92 
 
 
161 aa  79.7  1e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2293  7-cyano-7-deazaguanine reductase  34.41 
 
 
154 aa  80.1  1e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156672  normal  0.158019 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2723  7-cyano-7-deazaguanine reductase  34.65 
 
 
118 aa  79.7  1e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0512  7-cyano-7-deazaguanine reductase  39.08 
 
 
153 aa  79.3  2e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.642782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0282  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.38 
 
 
119 aa  79.3  2e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.290856  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2007  7-cyano-7-deazaguanine reductase  35.87 
 
 
155 aa  78.2  3e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1844  7-cyano-7-deazaguanine reductase  34.83 
 
 
174 aa  78.6  3e-14  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4288  7-cyano-7-deazaguanine reductase  37.5 
 
 
150 aa  78.6  3e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.542741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2044  7-cyano-7-deazaguanine reductase  36.78 
 
 
154 aa  77.8  5e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1742  7-cyano-7-deazaguanine reductase  35.79 
 
 
158 aa  77.4  6e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1828  7-cyano-7-deazaguanine reductase  35.79 
 
 
158 aa  77.4  7e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6510  7-cyano-7-deazaguanine reductase  34.83 
 
 
150 aa  76.3  1e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4182  7-cyano-7-deazaguanine reductase  36.78 
 
 
154 aa  76.6  1e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  1.04861e-05  normal  0.570077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>