15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0005 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0005  conserved hypothetical protein (DUF511 domain protein)  100 
 
 
333 aa  667  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1774  HrgA protein  54.49 
 
 
312 aa  310  3e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.508173  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1589  HrgA protein  52 
 
 
300 aa  307  2e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1623  hypothetical protein  43.73 
 
 
320 aa  261  9e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1717  hypothetical protein  40.12 
 
 
312 aa  212  6e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0511  hypothetical protein  39.75 
 
 
308 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.457472  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1748  HrgA protein  36.53 
 
 
319 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0030  hypothetical protein  36.13 
 
 
311 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.304564  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2290  hypothetical protein  31.6 
 
 
316 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0238  hypothetical protein  36.46 
 
 
312 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2191  hypothetical protein  31.2 
 
 
316 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.25203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0886  hypothetical protein  35.14 
 
 
315 aa  120  2e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4243  hypothetical protein  44.12 
 
 
105 aa  84  4e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025011 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4242  hypothetical protein  32.93 
 
 
201 aa  50.1  6e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2021  hypothetical protein  42.11 
 
 
70 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.101618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>