More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0001 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
442 aa  897  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  69.32 
 
 
440 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  68.86 
 
 
440 aa  621  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  69.09 
 
 
440 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1853  chromosomal replication initiation protein  62.16 
 
 
436 aa  535  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  60.78 
 
 
436 aa  535  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  58.35 
 
 
436 aa  508  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.02 
 
 
441 aa  482  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  47.59 
 
 
435 aa  423  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.7 
 
 
437 aa  388  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.11482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  37.67 
 
 
458 aa  305  8e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  36.67 
 
 
450 aa  303  4e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  44.67 
 
 
460 aa  302  6e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  36.3 
 
 
450 aa  302  7e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  39.26 
 
 
449 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  36.64 
 
 
445 aa  299  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 
443 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.41 
 
 
444 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  36.53 
 
 
450 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.48 
 
 
446 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 
446 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 
446 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 
446 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 
446 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 
446 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 
446 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 
446 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 
446 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  35.62 
 
 
446 aa  289  5e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  37.73 
 
 
459 aa  289  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  34.15 
 
 
446 aa  287  3e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.71 
 
 
458 aa  285  2e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  40.12 
 
 
457 aa  283  4e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  40.12 
 
 
457 aa  283  5e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.95 
 
 
454 aa  282  8e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.15 
 
 
463 aa  282  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  36.12 
 
 
445 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  36.86 
 
 
441 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 
442 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.06 
 
 
443 aa  279  7e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.12 
 
 
454 aa  279  8e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  35.57 
 
 
452 aa  279  8e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  5.82235e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.01 
 
 
453 aa  279  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.16 
 
 
446 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  35.6 
 
 
452 aa  275  1e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
453 aa  275  1e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
453 aa  275  1e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.28 
 
 
587 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  33.87 
 
 
451 aa  273  4e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  33.87 
 
 
451 aa  273  4e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.98 
 
 
591 aa  273  4e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  35.57 
 
 
451 aa  272  8e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  33.84 
 
 
465 aa  272  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.26 
 
 
439 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  36.05 
 
 
436 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 
465 aa  270  3e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.92 
 
 
515 aa  270  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  33.55 
 
 
463 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.4 
 
 
447 aa  269  8e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  36.3 
 
 
450 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.22878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.69 
 
 
461 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.97 
 
 
462 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  32.9 
 
 
462 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  32.9 
 
 
462 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  37.43 
 
 
478 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  32.89 
 
 
450 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.34969e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.03 
 
 
439 aa  266  6e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.12 
 
 
464 aa  266  6e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  32.81 
 
 
468 aa  266  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.52796e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  32.74 
 
 
472 aa  266  7e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  32.13 
 
 
451 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  7.64641e-07  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  36.36 
 
 
472 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  32.81 
 
 
468 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  31.97 
 
 
460 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 
462 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  39.02 
 
 
582 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  5.23076e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
455 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 
462 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  39.18 
 
 
443 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 
462 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 
462 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  32.2 
 
 
460 aa  264  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  32.2 
 
 
460 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  32.2 
 
 
460 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.48 
 
 
469 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.62 
 
 
442 aa  263  5e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
467 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
467 aa  263  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.41 
 
 
467 aa  263  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
467 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.58594e-06  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.35 
 
 
461 aa  263  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  33.41 
 
 
467 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
467 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
467 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
467 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  31.67 
 
 
461 aa  262  7e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4117  chromosomal replication initiation protein  32.89 
 
 
465 aa  262  7e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  9.31933e-05  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  32.58 
 
 
461 aa  262  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.63579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.62 
 
 
483 aa  262  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.64 
 
 
528 aa  262  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>