More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3718 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  100 
 
 		 110 aa  224  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  59.43 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  55.45 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  50.94 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  52.38 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  50.49 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  50.5 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  48.6 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  48.6 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  47.06 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  49.53 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  52.48 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  45.71 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  51.55 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  46.08 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  46.67 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  48.08 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  46.67 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  51.46 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  51.92 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  45.79 
 
 		 107 aa  116  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  46.08 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  46.08 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  47.17 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  55.1 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  49.52 
 
 		 107 aa  115  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  55.1 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  48.04 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  48.04 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  49.51 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  49.51 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  51.02 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  45.28 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  47.66 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  46.73 
 
 		 108 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  48.04 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  48.48 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  50.52 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  47.66 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  48.57 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  43.81 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  50.5 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  51.38 
 
 		 109 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  48.54 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  48.08 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  43.64 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  52.75 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  52.48 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  45.1 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  48.08 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  47.52 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  50.51 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  52.04 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  53.85 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  46.73 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  47.66 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  48.04 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  47.52 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  47 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  47.62 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  47.62 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  47.62 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  46.53 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  45.79 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  45.71 
 
 		 107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  56.25 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  45.45 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  46.46 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  47 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  44 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  48.98 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  47.96 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  45.54 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  44.76 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  43.81 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  44.66 
 
 		 223 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  48.04 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  47.62 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>