More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3653 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
347 aa  678    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  87.36 
 
 
349 aa  545  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  70.32 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  64.51 
 
 
337 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  60.75 
 
 
337 aa  358  7e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.67 
 
 
219 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  50.72 
 
 
215 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.35 
 
 
227 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.63 
 
 
227 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  46.27 
 
 
223 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  45.23 
 
 
222 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  63.57 
 
 
136 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 
217 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 
217 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 
217 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  61.42 
 
 
136 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  58.02 
 
 
135 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.27 
 
 
138 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  44.07 
 
 
225 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  54.74 
 
 
140 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  45.83 
 
 
225 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  57.48 
 
 
136 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.73 
 
 
135 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.33 
 
 
139 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  55.3 
 
 
136 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.12 
 
 
137 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.36 
 
 
139 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.12 
 
 
139 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  57.48 
 
 
147 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.48 
 
 
143 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.69 
 
 
135 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.63 
 
 
453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  56.25 
 
 
148 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.39 
 
 
229 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  59.17 
 
 
138 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.48 
 
 
136 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.54 
 
 
150 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.12 
 
 
150 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  52.99 
 
 
498 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.67 
 
 
141 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  52.38 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.77 
 
 
141 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  52.76 
 
 
174 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  47.86 
 
 
294 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  48.82 
 
 
157 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.78 
 
 
130 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.8 
 
 
147 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  53 
 
 
113 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
125 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
125 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
125 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 
125 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  51 
 
 
104 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  56.67 
 
 
120 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  48.25 
 
 
126 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  53.85 
 
 
183 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
127 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 
119 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  49.49 
 
 
120 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
123 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  56.1 
 
 
118 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
137 aa  102  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  55.29 
 
 
112 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  54.88 
 
 
123 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  43.85 
 
 
148 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  48.48 
 
 
120 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  42.74 
 
 
116 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  38.27 
 
 
255 aa  100  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.27 
 
 
115 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  41.26 
 
 
151 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  53.66 
 
 
122 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  51.11 
 
 
127 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
125 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  39.72 
 
 
147 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.08 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 
129 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  40.32 
 
 
137 aa  97.4  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  45.37 
 
 
131 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  41.79 
 
 
142 aa  96.7  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 
126 aa  96.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 
105 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.08 
 
 
140 aa  96.3  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 
124 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
123 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 
120 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  50.59 
 
 
125 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.93 
 
 
151 aa  93.6  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
124 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
136 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 
125 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 
116 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
132 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 
127 aa  90.9  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  54.93 
 
 
109 aa  90.5  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  50.67 
 
 
126 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  42.19 
 
 
138 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 
127 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 
137 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>