More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3549 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  100 
 
 
308 aa  607  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  67.93 
 
 
306 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  67.47 
 
 
309 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  67.81 
 
 
308 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  67.01 
 
 
308 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  66.55 
 
 
306 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  64.77 
 
 
340 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  63.1 
 
 
311 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  65.12 
 
 
309 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  62.33 
 
 
300 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  65.31 
 
 
302 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  67.59 
 
 
297 aa  367  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  64.73 
 
 
305 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  64.71 
 
 
312 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  56.51 
 
 
302 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  65.05 
 
 
316 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.36 
 
 
312 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  63.23 
 
 
302 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  63.92 
 
 
302 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  62.54 
 
 
309 aa  362  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.44 
 
 
337 aa  362  6e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  61.24 
 
 
307 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  61.67 
 
 
306 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  62.2 
 
 
301 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  63.7 
 
 
298 aa  358  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  62.63 
 
 
299 aa  358  8e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  61.77 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  61.77 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  61.77 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  55.21 
 
 
298 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  63.01 
 
 
308 aa  349  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  59.39 
 
 
300 aa  348  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  63.23 
 
 
305 aa  342  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.43 
 
 
317 aa  341  8e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.49 
 
 
324 aa  340  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  62.12 
 
 
300 aa  339  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  60.14 
 
 
302 aa  333  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  59.46 
 
 
317 aa  331  8e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  57.01 
 
 
328 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.75 
 
 
302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  61.11 
 
 
247 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  52.08 
 
 
307 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  52.08 
 
 
307 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  52.58 
 
 
304 aa  265  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  51.74 
 
 
307 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
304 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  41.02 
 
 
300 aa  235  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 
297 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  42.47 
 
 
307 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 
297 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 
297 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 
297 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 
297 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  37.8 
 
 
293 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 
297 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  37.8 
 
 
293 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
297 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  39.45 
 
 
305 aa  215  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  38.41 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.62 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
390 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  40.13 
 
 
307 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  43.54 
 
 
304 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
314 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
310 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  34.6 
 
 
293 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  41.64 
 
 
303 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  36.75 
 
 
299 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  39.46 
 
 
306 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  32.44 
 
 
291 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40 
 
 
305 aa  192  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  32.19 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  38.13 
 
 
313 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 
295 aa  187  2e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  38.73 
 
 
339 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
327 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  38.41 
 
 
303 aa  186  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  39.1 
 
 
334 aa  185  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  39.87 
 
 
309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
323 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  38.72 
 
 
308 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  26.74 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  42.09 
 
 
298 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  38.49 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  36.91 
 
 
303 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  40.96 
 
 
304 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  38.97 
 
 
310 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  31.97 
 
 
313 aa  175  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  39.12 
 
 
301 aa  175  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
250 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  40 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  37.97 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0074  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  35.67 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>