43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3463 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
188 aa  370  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3554  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 
127 aa  98.6  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1303  hypothetical protein  37.29 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0850702  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36370  histidine kinase  35.88 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4997  putative signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0081  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1572  putative signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
161 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11800  histidine kinase  36.36 
 
 
157 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243176  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  35.54 
 
 
693 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
135 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  35.14 
 
 
132 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  35.71 
 
 
135 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 
745 aa  48.5  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
716 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 
855 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
135 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.39 
 
 
613 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
136 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.04 
 
 
226 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 
192 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.56 
 
 
817 aa  44.7  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 
1225 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.2 
 
 
738 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  32.26 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.27 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 
122 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  30.65 
 
 
771 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1390  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.24 
 
 
468 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.057266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 
713 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  38 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  31.52 
 
 
743 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
146 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1581  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
149 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0308365  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0755  putative regulatory protein  32.14 
 
 
164 aa  42  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.5 
 
 
164 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.81 
 
 
549 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  29.41 
 
 
591 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
151 aa  41.2  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>