275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3385 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
147 aa  299  8.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 
140 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  45.92 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  41.28 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 
142 aa  57.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
145 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
142 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  56.52 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
153 aa  48.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  29.92 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  36.11 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  45.65 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
144 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  36.04 
 
 
162 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 
201 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
137 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  39.53 
 
 
162 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
137 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
411 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
187 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.12 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  36.84 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  32.69 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  41.46 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 
187 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
186 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
172 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
168 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  43.37 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
307 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2219  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 
153 aa  43.9  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
301 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  38.1 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>