136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3374 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  100 
 
 
683 aa  1298    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  54.87 
 
 
708 aa  636    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  56.63 
 
 
722 aa  643    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  53.83 
 
 
687 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  47.22 
 
 
718 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  51.18 
 
 
711 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  46.79 
 
 
718 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  45.33 
 
 
752 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  45.6 
 
 
697 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  49.32 
 
 
671 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  43.93 
 
 
708 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  40.79 
 
 
739 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  41.81 
 
 
631 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  37.78 
 
 
651 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  39.27 
 
 
687 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  41.11 
 
 
681 aa  362  9e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.21 
 
 
675 aa  353  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  38.24 
 
 
665 aa  350  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  38.09 
 
 
665 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  38.09 
 
 
665 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  39.51 
 
 
678 aa  347  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  39.88 
 
 
692 aa  333  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  37.94 
 
 
664 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.12 
 
 
731 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  38.95 
 
 
671 aa  319  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  39.88 
 
 
691 aa  317  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  40.12 
 
 
686 aa  316  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  42.13 
 
 
651 aa  316  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  42.86 
 
 
679 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  37.41 
 
 
736 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  42.14 
 
 
672 aa  291  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  36.75 
 
 
676 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  40.84 
 
 
719 aa  286  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  41.64 
 
 
661 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  35.87 
 
 
653 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  38.05 
 
 
632 aa  240  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  33.08 
 
 
642 aa  236  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  32.78 
 
 
646 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  32.07 
 
 
641 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  32.07 
 
 
641 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  31.75 
 
 
637 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.06 
 
 
319 aa  190  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  38.93 
 
 
310 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.61 
 
 
654 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  41.2 
 
 
328 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  35.38 
 
 
651 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  37.1 
 
 
322 aa  160  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  38.85 
 
 
319 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  34.32 
 
 
322 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  31.33 
 
 
331 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  31.33 
 
 
331 aa  134  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  32.29 
 
 
331 aa  134  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  34.17 
 
 
322 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  32.75 
 
 
326 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  32.74 
 
 
308 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  32.44 
 
 
604 aa  130  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.44 
 
 
613 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.64 
 
 
307 aa  123  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  29.61 
 
 
394 aa  97.8  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.69 
 
 
326 aa  97.4  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  24.35 
 
 
265 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  30.42 
 
 
387 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  24.72 
 
 
274 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  24.72 
 
 
277 aa  94.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  24.72 
 
 
277 aa  94.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  24.54 
 
 
277 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  23.99 
 
 
277 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  29.91 
 
 
354 aa  89  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  34.3 
 
 
273 aa  86.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  30.71 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  28.22 
 
 
327 aa  83.2  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  28.69 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  28.44 
 
 
270 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.94 
 
 
291 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  31.18 
 
 
547 aa  59.7  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  32.73 
 
 
277 aa  59.7  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  30.57 
 
 
290 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  32.73 
 
 
547 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  30.57 
 
 
290 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  26.85 
 
 
264 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  32.73 
 
 
544 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  38.62 
 
 
539 aa  58.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  28.82 
 
 
544 aa  57.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  31.82 
 
 
549 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  31.82 
 
 
439 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  31.82 
 
 
549 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  32.73 
 
 
547 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  29.56 
 
 
290 aa  57  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  29.56 
 
 
290 aa  57  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  29.56 
 
 
290 aa  57  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  29.56 
 
 
290 aa  57  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.82 
 
 
544 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.82 
 
 
544 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.51 
 
 
246 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  28.93 
 
 
290 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  31.15 
 
 
290 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  26.89 
 
 
322 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  32.47 
 
 
290 aa  55.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 
551 aa  54.7  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>