More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3361 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 491 aa  975    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  59.41 
 
 		 493 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  55.56 
 
 		 508 aa  530  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  50.92 
 
 		 492 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  50.72 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  52.15 
 
 		 494 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  51.92 
 
 		 494 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  50.51 
 
 		 492 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  50.51 
 
 		 492 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  51.92 
 
 		 494 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  50.4 
 
 		 498 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  49.36 
 
 		 493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  41.84 
 
 		 482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  36.75 
 
 		 483 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  35.4 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  34.95 
 
 		 492 aa  316  6e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  35.73 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  35.62 
 
 		 555 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  35.62 
 
 		 556 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  29.01 
 
 		 591 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  31.37 
 
 		 586 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  30.91 
 
 		 577 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  32.83 
 
 		 559 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  32.83 
 
 		 559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  32.83 
 
 		 559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  30.87 
 
 		 559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  32.83 
 
 		 559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  32.83 
 
 		 559 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  31.15 
 
 		 598 aa  183  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  31.45 
 
 		 565 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  29.96 
 
 		 544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  30.32 
 
 		 596 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  27.54 
 
 		 578 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  27.54 
 
 		 578 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  27.54 
 
 		 578 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  28.79 
 
 		 589 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  29.3 
 
 		 581 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  29.04 
 
 		 585 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 589 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  31.51 
 
 		 575 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  27.78 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  29.93 
 
 		 587 aa  170  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 586 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 586 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  33.85 
 
 		 568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  27.49 
 
 		 586 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  28.6 
 
 		 583 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 		 583 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  30.48 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  26.78 
 
 		 561 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  29.04 
 
 		 578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  25.75 
 
 		 643 aa  89  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  25.82 
 
 		 644 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  28.24 
 
 		 639 aa  86.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  27.25 
 
 		 657 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  31.54 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  28.15 
 
 		 652 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  25.99 
 
 		 638 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  32.04 
 
 		 1098 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  27.21 
 
 		 1098 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 645 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  28.96 
 
 		 567 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  27.21 
 
 		 1098 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  27.12 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  31.65 
 
 		 636 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  29.67 
 
 		 1105 aa  80.5  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  26.03 
 
 		 556 aa  79.7  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  30.77 
 
 		 1100 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  29.33 
 
 		 663 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  30.33 
 
 		 1099 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  26.89 
 
 		 646 aa  78.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  25.34 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  28.1 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  28.23 
 
 		 1105 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  24.84 
 
 		 651 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  32.11 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  23.36 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  32.39 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 		 672 aa  73.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  26.45 
 
 		 1137 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  26.45 
 
 		 1137 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  26.45 
 
 		 1137 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  26.37 
 
 		 667 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  25.94 
 
 		 587 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  28.95 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  25.44 
 
 		 1152 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  24.81 
 
 		 1098 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  24.94 
 
 		 1137 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  30.09 
 
 		 638 aa  70.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  25.07 
 
 		 1093 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  25.69 
 
 		 1136 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  27.86 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  24.94 
 
 		 1154 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  27.41 
 
 		 1110 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  24.69 
 
 		 1137 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  24.8 
 
 		 1093 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  24.34 
 
 		 1109 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  26.24 
 
 		 601 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  25.26 
 
 		 588 aa  68.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>