62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3317 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  100 
 
 		 555 aa  1082    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  44.91 
 
 		 563 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  44.91 
 
 		 563 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  44.22 
 
 		 549 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  45.31 
 
 		 550 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  43.97 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  45 
 
 		 551 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  30.58 
 
 		 559 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  29.54 
 
 		 574 aa  174  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24.52 
 
 		 568 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  28.14 
 
 		 579 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  25.53 
 
 		 578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  26.57 
 
 		 527 aa  99.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  28.67 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  29.54 
 
 		 541 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  28.15 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  25.37 
 
 		 606 aa  93.2  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  26.2 
 
 		 533 aa  90.5  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  28.44 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  31.05 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  26.21 
 
 		 557 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  26.45 
 
 		 555 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  26.13 
 
 		 555 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  25.26 
 
 		 593 aa  64.3  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  26.1 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  26.39 
 
 		 555 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  26.1 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  26.67 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  26.38 
 
 		 626 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  25.97 
 
 		 564 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  27.03 
 
 		 625 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  26.39 
 
 		 555 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  26.47 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  23.94 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3287  NERD domain protein  25 
 
 		 197 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  24.29 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  24.29 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  24.29 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  24.29 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  24.29 
 
 		 669 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2836  NERD domain protein  25 
 
 		 197 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  24.29 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  24.29 
 
 		 554 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  21.92 
 
 		 610 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  26.13 
 
 		 558 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  25.71 
 
 		 613 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  32.16 
 
 		 619 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.82 
 
 		 607 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  21.08 
 
 		 634 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  26.88 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1058  hypothetical protein  25.95 
 
 		 396 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0139648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  27.04 
 
 		 619 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  26.18 
 
 		 616 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  23.81 
 
 		 612 aa  47.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  23.26 
 
 		 601 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  30.08 
 
 		 662 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  27.75 
 
 		 388 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  23.72 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  28.37 
 
 		 719 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  25.31 
 
 		 607 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.84 
 
 		 838 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  19.72 
 
 		 827 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>