57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3302 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  838    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  34.38 
 
 
451 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  31.35 
 
 
438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  35.02 
 
 
440 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  33.79 
 
 
456 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  30.07 
 
 
422 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  31.05 
 
 
431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  29.42 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  30.25 
 
 
435 aa  167  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  29.82 
 
 
429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  31.72 
 
 
422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  33.77 
 
 
435 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  28.31 
 
 
417 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  28.95 
 
 
433 aa  160  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  32.21 
 
 
422 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  30.64 
 
 
394 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  52.55 
 
 
421 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  30.47 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  25.86 
 
 
407 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  25.81 
 
 
400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  25.29 
 
 
407 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  25.93 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  28.41 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  25.11 
 
 
432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  45.39 
 
 
465 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  29.31 
 
 
448 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  28.23 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  24.36 
 
 
459 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  23.68 
 
 
394 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  25.99 
 
 
456 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  22.84 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  36.57 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  22.61 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  30.89 
 
 
449 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2523  abortive infection protein  20.33 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.237288  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  25 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  22.66 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  26.92 
 
 
392 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  18.78 
 
 
458 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  31.03 
 
 
368 aa  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  21.81 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3170  putative abortive phage resistance  29.23 
 
 
488 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  29.55 
 
 
558 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  25.34 
 
 
530 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  19.68 
 
 
373 aa  46.6  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  28.81 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  26.96 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  41.67 
 
 
1167 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  31.07 
 
 
1165 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  32.04 
 
 
1511 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  32.1 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  32.05 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  22.47 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  22.47 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  27.93 
 
 
419 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  21.05 
 
 
430 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  28.26 
 
 
427 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>