156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3299 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
729 aa  1466    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  44.41 
 
 
698 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  42.69 
 
 
853 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.4 
 
 
626 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  40.34 
 
 
741 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.76 
 
 
743 aa  349  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  41.12 
 
 
743 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  38.71 
 
 
899 aa  316  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.27 
 
 
502 aa  222  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  42.47 
 
 
629 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  41.64 
 
 
539 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  39.79 
 
 
459 aa  193  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  39.79 
 
 
459 aa  193  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.45 
 
 
465 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.16 
 
 
683 aa  187  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.26 
 
 
568 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.43 
 
 
732 aa  176  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.5 
 
 
822 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  37.68 
 
 
810 aa  169  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  36.6 
 
 
805 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.85 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  36.84 
 
 
609 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  36.84 
 
 
609 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  37.09 
 
 
734 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  43.3 
 
 
655 aa  161  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  35.9 
 
 
700 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  37.32 
 
 
705 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  37.5 
 
 
781 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  38.6 
 
 
678 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.63 
 
 
754 aa  144  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  31.83 
 
 
638 aa  141  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  34.04 
 
 
587 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.87 
 
 
765 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.53 
 
 
590 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  39.01 
 
 
691 aa  133  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  38.57 
 
 
685 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.34 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.36 
 
 
685 aa  126  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  32.3 
 
 
666 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  36.31 
 
 
412 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  34.04 
 
 
303 aa  114  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  34.8 
 
 
450 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.24 
 
 
585 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  31.76 
 
 
999 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.36 
 
 
481 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  26.62 
 
 
845 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  33.33 
 
 
653 aa  109  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  35.06 
 
 
498 aa  106  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  30.52 
 
 
352 aa  107  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.15 
 
 
398 aa  106  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  30.71 
 
 
851 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  35.75 
 
 
687 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  28.19 
 
 
513 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.52 
 
 
795 aa  102  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  37.58 
 
 
498 aa  101  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  37.97 
 
 
696 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  26.87 
 
 
513 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  41.88 
 
 
834 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  40.12 
 
 
862 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  40 
 
 
517 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  36.57 
 
 
603 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  40 
 
 
605 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  34.25 
 
 
571 aa  99  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  37.14 
 
 
662 aa  97.8  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  38.33 
 
 
517 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.8 
 
 
603 aa  94.7  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.63 
 
 
723 aa  94  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  39.18 
 
 
900 aa  92  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  47.47 
 
 
598 aa  87.8  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.63 
 
 
449 aa  87.8  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.75 
 
 
722 aa  85.9  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  28.63 
 
 
803 aa  77.8  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.25 
 
 
410 aa  77  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  43.48 
 
 
772 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.9 
 
 
510 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.66 
 
 
530 aa  68.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  24.23 
 
 
597 aa  66.6  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.7 
 
 
606 aa  65.1  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  39.33 
 
 
842 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.44 
 
 
651 aa  62.4  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.22 
 
 
748 aa  62.4  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  22.9 
 
 
714 aa  59.3  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  22.9 
 
 
714 aa  59.3  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  25.13 
 
 
735 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  27.92 
 
 
391 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  30.37 
 
 
523 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  28.03 
 
 
792 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  30.9 
 
 
475 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  30 
 
 
403 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.24 
 
 
542 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  29.17 
 
 
712 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  25.86 
 
 
363 aa  55.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.41 
 
 
385 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  29.21 
 
 
474 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  26.59 
 
 
847 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  26.59 
 
 
843 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  21.99 
 
 
914 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  26.59 
 
 
844 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  23.93 
 
 
371 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.48 
 
 
559 aa  51.2  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>