More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3275 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  100 
 
 
177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  63.53 
 
 
184 aa  200  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  63.53 
 
 
184 aa  200  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  58.72 
 
 
303 aa  190  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  58.72 
 
 
303 aa  190  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  58.72 
 
 
303 aa  190  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  56.71 
 
 
294 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  52.41 
 
 
304 aa  164  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  54.04 
 
 
188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  60.31 
 
 
256 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  60.45 
 
 
136 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  50 
 
 
287 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  50.94 
 
 
158 aa  140  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  67.5 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5459  transposase IS4 family protein  47.85 
 
 
365 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00365854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  53.97 
 
 
145 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  46.5 
 
 
171 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  46.5 
 
 
171 aa  121  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  46.5 
 
 
171 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.29 
 
 
281 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.29 
 
 
281 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  48.55 
 
 
139 aa  115  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  48.55 
 
 
139 aa  115  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  47.83 
 
 
139 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  47.83 
 
 
139 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  47.83 
 
 
139 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  47.83 
 
 
139 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  47.83 
 
 
139 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.68 
 
 
281 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13890  transposase family protein  68.42 
 
 
103 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.417706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.68 
 
 
281 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  50.81 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  41.51 
 
 
138 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  41.88 
 
 
176 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  41.88 
 
 
176 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  46.04 
 
 
145 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  41.25 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  41.25 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  40.62 
 
 
177 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  40.62 
 
 
177 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  40.62 
 
 
177 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  40.62 
 
 
177 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  40.62 
 
 
177 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  53.7 
 
 
124 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.5 
 
 
251 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  39.49 
 
 
260 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2685  transposase, IS4  44.27 
 
 
131 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  37.95 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  41.77 
 
 
135 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  38.36 
 
 
142 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  38.82 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  36.25 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  36.25 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  36.25 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  38.36 
 
 
142 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  38.51 
 
 
164 aa  95.9  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  38.12 
 
 
255 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  37.27 
 
 
255 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  38.22 
 
 
254 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  38.22 
 
 
254 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  38.22 
 
 
254 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  38.22 
 
 
254 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  38.22 
 
 
254 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  36.65 
 
 
253 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  38.36 
 
 
260 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  38.36 
 
 
260 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  36.65 
 
 
255 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  37.89 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  38.36 
 
 
260 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  37.89 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  37.89 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  37.89 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  38.36 
 
 
260 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  36.65 
 
 
253 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  36.65 
 
 
253 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  36.94 
 
 
254 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  36.94 
 
 
254 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  36.94 
 
 
254 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  36.94 
 
 
254 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  36.94 
 
 
254 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  36.65 
 
 
253 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  36.94 
 
 
254 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  36.65 
 
 
253 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  35.85 
 
 
159 aa  91.3  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  39.29 
 
 
266 aa  91.3  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  36.65 
 
 
252 aa  91.3  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  36.65 
 
 
252 aa  90.9  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  36.65 
 
 
252 aa  90.9  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  36.65 
 
 
252 aa  90.9  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  36.65 
 
 
252 aa  90.9  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  36.65 
 
 
252 aa  90.9  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  36.65 
 
 
252 aa  90.9  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  36.65 
 
 
252 aa  90.9  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  36.65 
 
 
252 aa  90.9  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  33.12 
 
 
250 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  33.12 
 
 
250 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  36.24 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  35.44 
 
 
252 aa  88.6  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
146 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  34.18 
 
 
186 aa  89  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>