32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3085 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  100 
 
 
373 aa  712    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  44.44 
 
 
375 aa  278  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  50.86 
 
 
374 aa  266  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  42.78 
 
 
375 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  45.56 
 
 
379 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  47.63 
 
 
365 aa  259  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  43.18 
 
 
369 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  38.89 
 
 
389 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  40 
 
 
369 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  36.39 
 
 
396 aa  189  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  37.72 
 
 
359 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  33.61 
 
 
443 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  35.48 
 
 
367 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  35.86 
 
 
365 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  38.46 
 
 
371 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  38.49 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  36.2 
 
 
366 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  30.29 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  34 
 
 
399 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  35.09 
 
 
378 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  32.75 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  33.53 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  26.57 
 
 
431 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  29.46 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  29.61 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  26.5 
 
 
432 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  23.74 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  35.71 
 
 
176 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  28.25 
 
 
392 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  29.14 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  29.14 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  24.14 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>