252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3043 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  58.1 
 
 		 669 aa  740    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  56.22 
 
 		 746 aa  766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  61.13 
 
 		 743 aa  881    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  57.99 
 
 		 820 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  58.37 
 
 		 773 aa  899    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  100 
 
 		 774 aa  1534    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  61.68 
 
 		 744 aa  890    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  54.45 
 
 		 676 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  53.28 
 
 		 914 aa  610  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.38 
 
 		 833 aa  598  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  52.69 
 
 		 1266 aa  595  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  51.49 
 
 		 1065 aa  586  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  50.42 
 
 		 787 aa  570  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  51.32 
 
 		 662 aa  557  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  48.61 
 
 		 618 aa  558  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  48.58 
 
 		 672 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  49.08 
 
 		 677 aa  548  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  49.5 
 
 		 1880 aa  535  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  49.67 
 
 		 613 aa  538  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  47.54 
 
 		 658 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  44.22 
 
 		 616 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  68.62 
 
 		 240 aa  342  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  34.85 
 
 		 848 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  43.86 
 
 		 767 aa  266  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  40.76 
 
 		 1082 aa  258  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  41.85 
 
 		 851 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  38.44 
 
 		 803 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  30.24 
 
 		 606 aa  196  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.09 
 
 		 479 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  59.65 
 
 		 499 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  54.23 
 
 		 605 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  55.45 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  52.27 
 
 		 681 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  54.72 
 
 		 469 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  37.44 
 
 		 633 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.37 
 
 		 491 aa  120  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  54.05 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  59.79 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  35.59 
 
 		 455 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  51.72 
 
 		 974 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  42.7 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  56.64 
 
 		 829 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  55.34 
 
 		 596 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  34.8 
 
 		 854 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  55.77 
 
 		 495 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  50.48 
 
 		 913 aa  107  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  53.4 
 
 		 681 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  44.35 
 
 		 1128 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  41.03 
 
 		 842 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  44.44 
 
 		 767 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  46.3 
 
 		 609 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  46.28 
 
 		 846 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.49 
 
 		 588 aa  104  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  45.61 
 
 		 1055 aa  104  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  48.7 
 
 		 785 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.6 
 
 		 984 aa  102  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 812 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  43.65 
 
 		 438 aa  101  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.54 
 
 		 590 aa  100  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  43.97 
 
 		 446 aa  100  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  38.75 
 
 		 963 aa  99  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  43.94 
 
 		 589 aa  98.6  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  50.96 
 
 		 990 aa  97.8  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  43.09 
 
 		 1042 aa  97.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  48.04 
 
 		 623 aa  97.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  51.96 
 
 		 906 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  47.57 
 
 		 925 aa  96.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  53.4 
 
 		 489 aa  96.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.08 
 
 		 979 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  44.27 
 
 		 620 aa  96.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  47.57 
 
 		 688 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  49.02 
 
 		 543 aa  95.5  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  43.93 
 
 		 851 aa  95.5  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  48.04 
 
 		 842 aa  95.1  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 966 aa  95.1  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  44.14 
 
 		 934 aa  94.4  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  48.39 
 
 		 694 aa  94.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  46.6 
 
 		 494 aa  94  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  48.54 
 
 		 690 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  48.54 
 
 		 854 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  45.22 
 
 		 420 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  47.17 
 
 		 611 aa  92.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  46.08 
 
 		 518 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.97 
 
 		 633 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  46.03 
 
 		 847 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.06 
 
 		 646 aa  91.3  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  45.1 
 
 		 778 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.16 
 
 		 628 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  50.54 
 
 		 449 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  45.37 
 
 		 719 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  40.57 
 
 		 864 aa  88.6  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  45.56 
 
 		 456 aa  88.2  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  48.04 
 
 		 597 aa  87  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  44.33 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  46.79 
 
 		 942 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  42.72 
 
 		 580 aa  86.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.79 
 
 		 998 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.98 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  47.57 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  47.62 
 
 		 775 aa  85.1  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>