More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2717 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  74.07 
 
 		 431 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 443 aa  883    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  72.13 
 
 		 431 aa  623  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  67.97 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  61.36 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  58.69 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  61.12 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  60.19 
 
 		 430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  61.79 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  58.78 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  59.48 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  57.98 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  56.91 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  57.77 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  57.24 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  55.92 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  52.78 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  55.16 
 
 		 424 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  54.42 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  52.55 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  53.04 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  51.63 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  47.88 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  44.37 
 
 		 466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  37.56 
 
 		 436 aa  226  6e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  36.82 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  36.64 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  37.11 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  42.81 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  35.55 
 
 		 400 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  34.49 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  35.98 
 
 		 435 aa  183  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  35.93 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  32.02 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  35.65 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  31.74 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  35.16 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  31.74 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  31.74 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  32.11 
 
 		 411 aa  150  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  29.89 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  36.36 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  31.41 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  34.02 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  35.14 
 
 		 425 aa  136  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  29.26 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  34.23 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  32.1 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  31.52 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.57 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  34.24 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  33.33 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  29.97 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 395 aa  97.8  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.37 
 
 		 396 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 408 aa  96.7  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 		 381 aa  96.3  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.66 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.22 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  28.68 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.51 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  28.41 
 
 		 480 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  32.39 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 390 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 370 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 		 363 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.96 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  32.35 
 
 		 406 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.66 
 
 		 390 aa  87.8  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  30.45 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  29.76 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.18 
 
 		 387 aa  86.7  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  29.1 
 
 		 362 aa  86.3  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.05 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  24.88 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  20.1 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  27.39 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.55 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  31.45 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  21.33 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>