20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2540 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2540  protein of unknown function DUF456  100 
 
 
164 aa  293  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.658317  normal  0.52211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0664  hypothetical protein  47.06 
 
 
157 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4044  protein of unknown function DUF456  46 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16000  Protein of unknown function (DUF456)  44.44 
 
 
166 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148783  normal  0.0914905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1532  hypothetical protein  51.06 
 
 
163 aa  103  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0624636  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0722  hypothetical protein  49.02 
 
 
159 aa  100  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1686  protein of unknown function DUF456  39.86 
 
 
158 aa  92.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0085  hypothetical protein  41.73 
 
 
160 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0095  hypothetical protein  41.01 
 
 
160 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0104  hypothetical protein  41.01 
 
 
160 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3993  hypothetical protein  41.1 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2960  hypothetical protein  50.65 
 
 
158 aa  84  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0112  hypothetical protein  44.59 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3772  protein of unknown function DUF456  38.22 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0737  hypothetical protein  43.36 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19890  hypothetical protein  37.69 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.649353  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27270  Protein of unknown function (DUF456)  35.56 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.236002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28240  hypothetical protein  49.63 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1497  hypothetical protein  40.74 
 
 
220 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4908  hypothetical protein  39.82 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.417496  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>